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Enregistrement W4251204137 · doi:10.3410/f.717950351.793457950

Faculty Opinions recommendation of Bidirectional control of mRNA translation and synaptic plasticity by the cytoplasmic polyadenylation complex.

2012· dataset· en· W4251204137 sur OpenAlexaff
Luc DesGroseillers

Notice bibliographique

RevueFaculty Opinions – Post-Publication Peer Review of the Biomedical Literature · 2012
Typedataset
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeIntellectual and Developmental Disabilities Research CenterNational Institutes of HealthNational Alliance for Research on Schizophrenia and DepressionUniversity of MassachusettsUniversity of Massachusetts Medical SchoolEmory UniversityEpilepsy FoundationFRAXA Research Foundation
Mots-clésSynaptic plasticityLong-term potentiationPolyadenylationHippocampal formationCell biologyBiologyNeuroscienceMessenger RNAGeneticsGeneReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Translational control of mRNAs in dendrites is essential for certain forms of synaptic plasticity and learning and memory. CPEB is an RNA-binding protein that regulates local translation in dendrites. Here, we identify poly(A) polymerase Gld2, deadenylase PARN, and translation inhibitory factor neuroguidin (Ngd) as components of a dendritic CPEB-associated polyadenylation apparatus. Synaptic stimulation induces phosphorylation of CPEB, PARN expulsion from the ribonucleoprotein complex, and polyadenylation in dendrites. A screen for mRNAs whose polyadenylation is altered by Gld2 depletion identified >100 transcripts including one encoding NR2A, an NMDA receptor subunit. shRNA depletion studies demonstrate that Gld2 promotes and Ngd inhibits dendritic NR2A expression. Finally, shRNA-mediated depletion of Gld2 in vivo attenuates protein synthesis-dependent long-term potentiation (LTP) at hippocampal dentate gyrus synapses; conversely, Ngd depletion enhances LTP. These results identify a pivotal role for polyadenylation and the opposing effects of Gld2 and Ngd in hippocampal synaptic plasticity.Copyright © 2012 Elsevier Inc. All rights reserved. PMID: 22727665 Funding information This work was supported by: NICHD NIH HHS, United States Grant ID: R37 HD037267 NINDS NIH HHS, United States Grant ID: T32 NS007480 NICHD NIH HHS, United States Grant ID: P30 HD04147 NICHD NIH HHS, United States Grant ID: HD37267 NIGMS NIH HHS, United States Grant ID: R01 GM046779 NINDS NIH HHS, United States Grant ID: T32NS007480 NICHD NIH HHS, United States Grant ID: R01 HD037267 NIDDK NIH HHS, United States Grant ID: P30 DK32520 NICHD NIH HHS, United States Grant ID: P30 HD004147 NIA NIH HHS, United States Grant ID: R01 AG030323 NINDS NIH HHS, United States Grant ID: P30 NS055077 NIMH NIH HHS, United States Grant ID: MH092877 NIGMS NIH HHS, United States Grant ID: T32GM0860512 NINDS NIH HHS, United States Grant ID: R01 NS079415 NINDS NIH HHS, United States Grant ID: F31 NS063668 NIA NIH HHS, United States Grant ID: AG30323 NIMH NIH HHS, United States Grant ID: R01 MH085617 NIDDK NIH HHS, United States Grant ID: P30 DK032520 NIMH NIH HHS, United States Grant ID: MH085617 NINDS NIH HHS, United States Grant ID: F31NS063668 NIGMS NIH HHS, United States Grant ID: GM46779 NINDS NIH HHS, United States Grant ID: NS20752 NINDS NIH HHS, United States Grant ID: P30NS055077 More Less keyboard_arrow_down

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,007
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Évaluation · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,998
Score d'incertitude au seuil0,725

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,007
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0040,002
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0040,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,4920,276

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,338
Écart entre enseignants0,305 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
DomaineÉvaluation
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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