Peer Review #2 of "Early-life intestinal microbiome in Trachemys scripta elegans analyzed using 16S rRNA sequencing (v0.1)"
Notice bibliographique
Résumé
During the early-life period, the hatchlings of red-eared slider turtles (Trachemys scripta elegans) rely on their own post-hatching internal yolk for several days before beginning to feed.The gut microbiome is critical for the adaptation of organisms to new environments, but, to date, how the microbiome taxa are assembled during early life of the turtle is unknown.In this study, the intestinal microbiome of red-eared slider hatchlings (fed on commercial particle food) was systematically analyzed at four different growth stages (0d, 10d, 20d, 30d) by a high-throughput sequencing approach.Results showed that the dominant phyla were Firmicutes (58.23%) and Proteobacteria (41.42%) at 0-day, Firmicutes (92.94%) at 10-day, Firmicutes (67.08%) and Bacteroidetes (27.17%) at 20-day, and Firmicutes (56.46%),Bacteroidetes (22.55%) and Proteobacteria (20.66%) at 30-day post-hatching.Members of the Bacteroidaceae family were absent in 0-day and 10-day turtles, but dominated in 20-day and 30-day turtles.The abundance of Clostridium also showed the highest value in 10-day turtles.The richness of the intestinal microbiomes was lower at 0-day and 30-day than that at 10-day and 20-day, while the diversity was higher at 10-day and 30-day than that at 0-day and 20-day.The results endowed the turtles with an ability to enhance their tolerance to the environment.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,009 | 0,057 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,006 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,004 | 0,002 |
| Communication savante | 0,008 | 0,005 |
| Science ouverte | 0,003 | 0,007 |
| Intégrité de la recherche | 0,003 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,285 | 0,132 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».