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Enregistrement W4251579429 · doi:10.21105/joss.03702

BioPsyKit: A Python package for the analysis of biopsychological data

2021· article· en· W4251579429 sur OpenAlexaff
Robert Richer, Arne Küderle, Martin Ullrich, Nicolas Rohleder, Bjoern M. Eskofier

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Open Source Software · 2021
Typearticle
Langueen
DomainePsychology
ThématiqueMental Health Research Topics
Établissements canadiensArtificial Intelligence in Medicine (Canada)
Organismes subventionnairesDeutsche Forschungsgemeinschaft
Mots-clésPython (programming language)Computer scienceR packageProgramming language

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Biopsychology is a field of psychology that analyzes how biological processes interact with behaviour, emotion, cognition, and other mental processes.Biopsychology covers, among others, the topics of sensation and perception, emotion regulation, movement (and control of such), sleep and biological rhythms, as well as acute and chronic stress.To assess the interaction between biological and mental processes a variety of different modalities are used in the field of biopsychology, such as electrophysiology, assessed, for instance, via electrocardiography (ECG), electrodermal activity (EDA), or electroencephalography (EEG), sleep, activity and movement, assessed via inertial measurement units (IMUs), neuroendocrine and inflammatory biomarkers, assessed by saliva and blood samples, as well as self-reports, assessed via psychological questionnaires.These different modalities are collected either "in the lab," during standardized laboratory protocols, or "in the wild," during unsupervised protocols in home environments.The collected data are typically analyzed using statistical methods, or, more recently, using machine learning methods.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,010
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Logiciel · Signal consensuel: Logiciel
Score de désaccord entre enseignants0,089
Score d'incertitude au seuil0,298

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,010
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0030,004
Intégrité de la recherche0,0010,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0890,048

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,291
Tête enseignante GPT0,515
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreLogiciel

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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