Topino: A Graphical Tool for Quantitative Assessment of Molecular Stream Separations
Notice bibliographique
Résumé
<p><a></a> In molecular-stream separation (MSS), a stream of a multi-component mixture is separated into multiple streams of individual components. Quantitative evaluation of MSS data has been a bottleneck in MSS for decades as there was no conventional way to present the data in a reproducible and uniform fashion. The roots of the problem were in the multi-dimensional nature of MSS data; even in the ideal case of steady-state separation, the data is three-dimensional: intensity and two spatial coordinates. We recently found a way to reduce the dimensionality <i>via</i> presenting the MSS data in a polar coordinate system and convoluting the data <i>via</i> integration of intensity along the radius axis. The result of this convolution is an angulagram — a simple 2D plot presenting integrated intensity vs angle. Not only does an angulagram simplify the visual assessment, but it also allows the determination of three quantitative parameters characterizing the quality of MSS: stream width, stream linearity, and stream deflection. Reliably converting an MSS image into an angulagram and accurately determining the stream parameters requires an advanced and user-friendly software tool. In this technical note, we introduce such a tool: the open-source software Topino available at <u><a href="https://github.com/Schallaven/topino">https://github.com/Schallaven/topino</a></u>. Topino is a stand-alone program with a modern graphical user interface that allows processing an MSS image in a fast (<2 min) and straightforward way. The robustness and ruggedness of Topino were confirmed by comparing the results obtained by three users. Topino removes the analytical bottleneck in MSS and will be an indispensable tool for MSS users with varying levels of experience.</p> p { margin-bottom: 0.25cm; direction: ltr; line-height: 115%; text-align: left; orphans: 2; widows: 2 }a:link { color: #0000ff }
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».