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Enregistrement W4251620533 · doi:10.7287/peerj.preprints.26765

Antioxidant enzyme cycling over reproductive lunar cycles in <i>Pocillopora damicornis</i>

2018· preprint· en· W4251620533 sur OpenAlexaff
James WA Murphy, Abby C. Collier, Robert H. Richmond

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typepreprint
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueCoral and Marine Ecosystems Studies
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCoralAntioxidantGlutathione reductaseCoral reefGlutathione peroxidaseSuperoxide dismutaseBiologyCatalaseOxidative stressReefZoologyEcologyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The impacts of continued degradation of watersheds on coastal coral reefs world-wide is alarming. Action addressing anthropogenic stressors and subsequent rehabilitation of watersheds and adjacent reefs is an urgent priority. The aim of this study is to develop and improve the use of antioxidant enzymes as biomarkers in coral species. In order to fully develop such tools, it is necessary to perform sampling of coral tissues over reproductive cycles to determine variations from baseline. By developing a greater understanding of biochemical markers of stress in corals, specifically antioxidant defense enzymes: superoxide dismutase (SOD), catalase (CAT), glutathione peroxidase (GPx), and glutathione reductase (GR), we have provided molecular tools that identify thresholds of stress on coral reefs. Our results suggest that the coral reproductive state is a significant factor affecting the activity of antioxidant enzymes. Specifically, CAT (65.92 mmol/min/mg protein, p = 0.0177) and GR (12.64 nmol/min/mg protein, p < 0.0001) display maximum activity during peak reproductive state. Whereas significant maximal SOD (154.92 nmol/min/mg protein, p < 0.0454) and Se-independent GPx (5.35 nmol/min/mg protein, p = 0.0001) activity was measured during off-peak reproductive cycles. Such insight into the cyclical variation of the activity of these enzymes should be applied towards differentiating the influence of natural biological activity cycling in diagnostic tests identifying the effects of different physical environmental factors and chemical pollutants on coral health. Through the development and application of these molecular biomarkers of stress, we look to improve our ability to identify problems at the sub-lethal level, when action can be taken to mitigate a/biotic impacts.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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