AMMI Canada – CACMID Annual Conference
Notice bibliographique
Résumé
Objective: Similar to cancer cells, HIV-infected cells differ from HIVuninfected cells in that they have altered interferon signaling pathways, the apparent reason for the selectivity of certain oncolytic viruses (OVs).The objective of this study was to determine whether the OV recombinant Maraba virus (MG1) would have a greater propensity to target and kill HIV-infected cells compared to non-infected cells.MethOds: U1, ACH-2, OM-10 and J1.1 cells, harbouring 1-2 copies of integrated proviral DNA per cell, were infected with varying multiplicities of infection (MOI) of green fluorescent protein (GFP)-encoded MG1.Controls included HIV-uninfected U937, A301, HL60 and Jurkat parent lines.CD4+CD25-HLADR-cells from 20 HIV-infected individuals on antiretroviral therapy were infected with MG1 and flow cytometry and MTT assay were performed to quantify MG1 infection and cell viability, respectively.PCR for total HIV DNA in cells, in addition to RT-PCR for total HIV RNA and ELISA for p24 antigen on cell-free supernatants, were performed after a 2-week stimulation period.Results: MG1 infected and killed a greater proportion of U1 than U937 cells at most MOIs tested but this was not observed in the other cell lines.With the initial experimental approach, MG1 did not appear to infect CD4 + CD25 -HLADR -cells and viability appeared preserved.Similarly, we were unable to detect any effect of MG1 on quantities of total HIV DNA in cells, or total HIV RNA or p24 antigen levels in supernatants.cOnclusiOn: MG1 infects and kills latently HIV-infected U1 cells to a greater degree than the HIV-uninfected parent U937 cells and may be a promising model to facilitate further studies of MG1 as a potential therapy for the eradication of latently HIV-infected cells.Further optimization of the experimental approach for primary cell experiments is required in order to determine the effect of MG1 on cells which constitute the HIV reservoir.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,004 | 0,001 |
| Communication savante | 0,005 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,003 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,470 | 0,138 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».