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Enregistrement W4252345694 · doi:10.1158/1538-7445.am2012-5063

Abstract 5063: International Cancer Genome Consortium (ICGC)

2012· article· en· W4252345694 sur OpenAlexaffabout
Thomas J. Hudson, Jennifer L. Jennings

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer Genomics and Diagnostics
Établissements canadiensOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCancerBreast cancerGenomeMedicineOncologyBiologyFamily medicineInternal medicineGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The International Cancer Genome Consortium (ICGC) was established to bring together researchers from around the globe to comprehensively analyze the genomic, transcriptomic, and epigenomic changes in 50 different tumor types or subtypes that are of clinical and societal importance across the globe. (International network of cancer genome projects (Nature 464, 993-998 (15 April 2010)). As of November 2011, the ICGC has received commitments from funding organizations in Asia, Australia, Europe and North America for 43 project teams in 13 jurisdictions to study over 18,000 tumor genomes. The genomic analyses of tumors conducted by ICGC members in Australia and Canada (pancreatic cancer), Japan (liver cancer), Spain (blood cancer), the UK (breast, lung and skin cancer) and the USA (blood, brain, breast, colon, kidney, lung, ovarian, rectal, stomach and uterine cancer) are now available through the Data Coordination Center housed on the ICGC website at www.icgc.org. The ICGC's informed consent and ethical oversight policies state that cancer patients enrolled in an ICGC-related study should be informed that their participation is voluntary, that their clinical care will not be affected by their participation and that data obtained from analyses using their samples will be made available to the international research community. Ultimately, over 25,000 tumor genomes will be sequenced worldwide. This will provide a comprehensive catalogue of genomic abnormalities associated with cancer, a collection of data that will reveal the repertoire of mutations that cause this wide-ranging disease and help define clinically relevant subtypes of cancer. The data will also provide a rich resource for the world's researchers who are working to develop new treatments to make patient care move forward. Citation Format: {Authors}. {Abstract title} [abstract]. In: Proceedings of the 103rd Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2012 Mar 31-Apr 4; Chicago, IL. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2012;72(8 Suppl):Abstract nr 5063. doi:1538-7445.AM2012-5063

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,027
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,037
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,117
Score d'incertitude au seuil0,251

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0270,037
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0080,015
Études des sciences et des technologies0,0030,001
Communication savante0,0080,002
Science ouverte0,0060,007
Intégrité de la recherche0,0060,006
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0750,028

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,070
Tête enseignante GPT0,407
Écart entre enseignants0,337 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
Routes d'admission2
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