Notice bibliographique
Résumé
Abstract Me.thy.lo.fe'ru.la. N.L. n. methylum the methyl group; N.L. pref. methylo ‐ pertaining to the methyl radical; L. fem. n. ferula a rod; N.L. fem. n. Methyloferula methyl‐using rod. The genus Methyloferula accommodates acidophilic, obligately methanotrophic bacteria that perform the first step of methane oxidation using only a soluble methane monooxygenase, rather than the more common particulate methane monooxygenase. Cells of these methanotrophs are Gram‐negative, aerobic, colorless, nonmotile rods that reproduce by irregular fission and occur singly or are arranged in rosettes. An extensive intracytoplasmic membrane system common to most known methanotrophic bacteria is absent from cells. Intracellular granules of poly‐β‐hydroxybutyrate are formed at each cell pole. Colonies are small, unpigmented, circular, and smooth. Growth occurs on methane and methanol; the latter is the preferred growth substrate. Carbon is assimilated via the serine and ribulose‐bisphosphate pathways. These methanotrophs are capable of atmospheric nitrogen fixation under reduced oxygen tension. They are mesophilic and psychrotolerant bacteria, which prefer dilute media of low salt content. The major fatty acid is C 18:1 ω7 c ; the major quinone is Q‐10. DNA G + C content is 59.5 mol% (genome analysis). Known habitats are acidic peatlands and soils. Type species : Methyloferula stellata Vorobev, Baani, Doronina, Brady, Liesack, Dunfield, and Dedysh 2011, 2461 VP . Taxonomic and Nomenclature Notes According to the List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), the taxonomic status of the genus Methyloferula is: correct name (last update, February 2025) * . LPSN classification: Bacteria / Pseudomonadati / Pseudomonadota / Alphaproteobacteria / Hyphomicrobiales / Beijerinckiaceae / Methyloferula The genus Methyloferula can also be recovered in the Genome Taxonomy Database (GTDB) as g__Methyloferula (version v220) ** . GTDB classification: d__Bacteria / p__Pseudomonadota / c__Alphaproteobacteria / o__Rhizobiales / f__Beijerinckiaceae / g__Methyloferula * Meier‐Kolthoff et al. ( 2022 ). Nucleic Acids Res , 50 , D801 – D807 ; DOI: 10.1093/nar/gkab902 ** Parks et al. ( 2022 ). Nucleic Acids Res , 50 , D785 – D794 ; DOI: 10.1093/nar/gkab776
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,234 | 0,120 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».