BIDSonym - a BIDSapp for the pseudo-anonymization of neuroimaging datasets
Notice bibliographique
Résumé
The amount of neuroimaging data being shared increased exponentially in recent years. While thisdevelopment introduces prominent advantages concerning open, reproducible and sustainable neu-roimaging, the process of data sharing must ensure the privacy of participant data. A requirement fromboth, Ethics Review Boards and data sharing resources, datasets need to be (pseudo-) anonymized priorto sharing in order to limit participant re-identification. Depending on the dataset at hand, this processcan however become cumbersome and prone to errors. Here we introduce BIDSonym, a tool for auto-mated pseudo-anonymization of neuroimaging datasets. BIDSonym supports multiple de-identificationprocedures and operates on neuroimaging, as well as metadata files. In addition, all metadata infor-mation present in the respective files is gathered and evaluated. Its outputs furthermore allow usersto conduct a more in-depth assessment of potentially sensitive information present in a given dataset.Through its workflow and utilization of the Brain Imaging Data Structure (BIDS), BIDSonym’s appli-cation is reproducible, requires no manual intervention and is agnostic to idiosyncrasies of small andlarge scale datasets.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,031 | 0,098 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,003 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,003 |
| Bibliométrie | 0,006 | 0,005 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,003 |
| Communication savante | 0,011 | 0,014 |
| Science ouverte | 0,005 | 0,026 |
| Intégrité de la recherche | 0,003 | 0,004 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,052 | 0,037 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».