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Enregistrement W4252560077 · doi:10.1042/0264-6021:3480159

Identification of amino acids imparting acceptor substrate selectivity to human arylamine acetyltransferases NAT1 and NAT2

2000· article· en· W4252560077 sur OpenAlexafffund
Geoffrey H. GOODFELLOW, Jean‐Marie Dupret, Denis M. Grant

Notice bibliographique

RevueBiochemical Journal · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueMass Spectrometry Techniques and Applications
Établissements canadiensHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilMedical Research Council CanadaHospital for Sick Children
Mots-clésAcetyltransferasesIdentification (biology)ChemistrySubstrate (aquarium)AcceptorSelectivityBiochemistryAmino acid residueStereochemistrySubstrate specificityCombinatorial chemistryAcetylationBiologyPeptide sequenceEnzymeGeneCatalysisPhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The human arylamine N-acetyltransferases NAT1 and NAT2 catalyse the acetyl-CoA-dependent N-and O-acetylation of primary arylamine and hydrazine xenobiotics and their Nhydroxylated metabolites. We previously used a panel of recombinant NAT1\NAT2 chimaeric proteins to identify linear amino acid segments that have roles in imparting the distinct catalytic specificities to these proteins [Dupret, Goodfellow, Janezic and Grant (1994) J. Biol. Chem. 269, 26830-26835]. These studies indicated that a conserved central region (residues 112-210) distinct from that containing the active-site cysteine residue Cys') was important in determining NAT substrate selectivity. In the present study we have refined our analysis through further chimaera generation of this conserved region and by subsequent site-directed mutagenesis of individual amino acids. Enzymekinetic analysis of these mutant proteins with the NAT1-selective and NAT2-selective substrates p-aminosalicylic acid (PAS) and Abbreviations used : Ac-CoA, acetyl-CoA ; NAT, arylamine N-acetyltransferase ; NAT1 4 and N1, wild-type NAT1 ; NAT2 4 and N2, wild-type NAT2 ; PAS, p-aminosalicylic acid ; SMZ, sulphamethazine.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,998

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,281
Écart entre enseignants0,270 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2000
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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