Faculty Opinions recommendation of Selective 40S Footprinting Reveals Cap-Tethered Ribosome Scanning in Human Cells.
Notice bibliographique
Résumé
Translation regulation occurs largely during the initiation phase. Here, we develop selective 40S footprinting to visualize initiating 40S ribosomes on endogenous mRNAs in vivo. This reveals the positions on mRNAs where initiation factors join the ribosome to act and where they leave. We discover that in most human cells, most scanning ribosomes remain attached to the 5' cap. Consequently, only one ribosome scans a 5' UTR at a time, and 5' UTR length affects translation efficiency. We discover that eukaryotic initiation factor 3B (eIF3B,) eIF4G1, and eIF4E remain bound to 80S ribosomes as they begin translating, with a decay half-length of ∼12 codons. Hence, ribosomes retain these initiation factors while translating short upstream open reading frames (uORFs), providing an explanation for how ribosomes can reinitiate translation after uORFs in humans. This method will be of use for studying translation initiation mechanisms in vivo.Copyright © 2020 Elsevier Inc. All rights reserved. PMID: 32589966
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,007 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,004 | 0,006 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,027 | 0,035 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».