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Enregistrement W4252712565 · doi:10.32920/ryerson.14657247.v1

A Novel Transcription-Interference Mechanism To Suppress Checkpoint

2021· preprint· en· W4252712565 sur OpenAlexafffund
Liza Marie Hayley Calhoun

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA Repair Mechanisms
Établissements canadiensTrent UniversityToronto Metropolitan University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésSchizosaccharomyces pombeHomologous recombinationG2-M DNA damage checkpointBiologyDNA repairDNA damageGeneticsSchizosaccharomycesCell biologyChromosome segregationCell cycle checkpointCHEK1GeneMeiosisProphaseGene silencingTranscription factorDNASaccharomyces cerevisiaeCell cycleChromosome

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Meiosis is a linear differentiation pathway remarkable for deliberate DNA damage. During meiotic prophase, DNA damage checkpoint is repressed, which may promote homologous recombination and repair. Meiotic breaks are known to influence meiotic chromosome segregation, preventing aneuploidy in gametes. Convergent genes cause transcriptional interference through overlapping transcripts, resulting in gene suppression. This general mechanism of gene silencing has been noted in both yeast and metazoans. In Schizosaccharomyces pombe, chk1⁺ is convergent with the meiotically upregulated meu27⁺ gene. Through gain- and loss-of-function assays we are developing a model of checkpoint regulation during nitrogen stress. We find that altered meu27⁺ expression impacts chk1⁺ mRNA levels, DNA segregation, and cell cycle progression. S. pombe encodes several DNA damage checkpoint genes that are convergent with stress-inducible transcripts. Therefore, we investigate the possibility that convergent transcription is a mechanism altering DNA damage repair during other stresses and differentiation programmes which may trigger unregulated cell division.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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