P35.22 WITHDRAWN
Notice bibliographique
Résumé
pulmonary lymphoepithelioma-like carcinoma (PLELC), a rare subtype of non-small cell lung cancer (NSCLC).However, the understanding of the treatment for EBV-infected NSCLC was still elusive.Immunotherapy that targets PD-1/PD-L1 has been utilized as a novel clinical treatment in recent years.Here, we focus on the genomic landscapes of lung cancers with EBV-infection and its correlation with PD-L1.Methods: Patients with both PD-L1 expression detection and genomic information were screened in HapLab database.HaploX 605-gene panel sequencing, covering 1.31 MB genome, was performed to analyze the genomic data of patients.PD-L1 expression was detected by immunochemistry.Bioinformatic analysis of genomic mutations and the correlation with the expression of PD-L1 were studied.Results: We analyzed the genomic profiles of 23 EBV-infected NSCLC patients.11 cases of lung squamous-cell carcinoma (LUSC), 4 cases of lung adenocarcinoma (LUAD), 5 cases of lung pulmonary lymphoepithelioma-like carcinoma (PLELC), and 3 unidentified cases were included in this study.Collectively, 93 genome mutations of 67 genes were detected in 23 EBV-infection cases.Top 3 frequently mutated genes were TP53 (27%), CSMD3 (18%) and KMT2D (18%).The EBV-infected patients exhibited a low level of tumor mutation burden (TMB).The median TMB was 1.53 Muts/MB (ranging from 0 to 14.5 Muts/MB).Only 3 of 23 patients (13.0%) harbored the canonical driver mutations in NSCLC.Interestingly, 10/23 patients (43.5%) showed high expression of PD-L1, while 13/23 patients (56.5%) showed low expression.We also assessed the expression of PD-L1 in lung cancers with no EBV-infection (867 cases).Only 118/867 (13.6%) patients without EBV-infection presented high PD-L1 expression, while 749/867 (86.4%) presented low PD-L1 expression.Conclusion: EBV-infection can occur in different kinds of NSCLC, including LUSC, LUAD, and PLELC.TMB and driver mutations of EBV-infected NSCLC were not frequently observed as normal lung cancers, implying a different mechanism leading to EBVinfected lung cancers.Interestingly, EBV-infected NSCLC tended to have a high correlation with the expression of PD-L1.This may give a hint on the application of checkpoint blockade immunotherapy on EBV-infected NSCLC.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,007 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,007 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,003 | 0,003 |
| Intégrité de la recherche | 0,006 | 0,003 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,880 | 0,836 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; l’étiquette directe de Gemma et le classifieur distillé Codex s’accordent sur ce qui est montré ici.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».