MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4253351120 · doi:10.5858/2006-130-13b-iaafsf

IBF as a Formalin Substitute Fixative in Prostate Biopsy Pathology

2006· letter· en· W4253351120 sur OpenAlexaffabout
Kiril Trpkov, Peter Renault, Aslı Yilmaz, Nihad Ali-Ridha

Notice bibliographique

RevueArchives of Pathology & Laboratory Medicine · 2006
Typeletter
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueProstate Cancer Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensLakeridge HealthCalgary Laboratory ServicesUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFixativeH&E stainProstatePathologyProstate cancerSurgical pathologyBiopsyFixation (population genetics)MedicineStainingCancerInternal medicinePopulation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

To the Editor.—We read with interest the study by Titford and Horenstein,1 who concluded that formalin fixation in comparison with 5 formalin substitutes provided the highest histomorphologic quality for 7 different surgical pathology specimens stained with hematoxylin-eosin. However, fixatives other than formalin are widely used in selected areas of surgical pathology practice because they provide for better evaluation of specific diagnostic criteria in different tissues and tumors (eg, B-Plus Fix in lymphomas).Optimal fixation of prostate biopsies is of utmost importance for biopsy evaluation. Most laboratories fix prostate biopsies in 10% neutral-buffered formalin, which often produces suboptimal, smudged, or blurred nuclear morphology. Nucleus-enhancing fixatives, such as Bouin and Hollande fixatives, are also used for prostate biopsy fixation and contain picric acid, which is biohazardous and potentially explosive when dry.2 Bouin fixative has been reported to decrease the immunoreactivity for cytokeratin.3 Since 1993, we have routinely fixed all prostate biopsies in our institution with IBF fixative (Surgipath, Richmond, Ill), which contains isopropyl alcohol, methanol, barium chloride, and low percent formalin (<3% by weight). Since 2000, we have processed more than 7000 prostate biopsies in IBF through our centralized urologic pathology practice in Calgary, Alberta. Prostate cores are typically placed in 30-mL containers with IBF immediately after the biopsy and are fixed between 3 and 24 hours in IBF, which is followed by routine processing. IBF-fixed prostate biopsies consistently exhibit excellent cellular morphology on hematoxylin-eosin staining. Prostate cancer glands demonstrate crisp nuclear morphology with clearly visible and prominent nucleoli, which is particularly helpful in establishing a diagnosis of high-grade prostatic intraepithelial neoplasia and small foci of prostatic cancer. Since other diagnostic features of prostatic cancer in IBF-fixed biopsies are identical to those seen in formalin-fixed biopsies, having an opportunity to see the nucleoli clearly in the atypical or suspicious glands may resolve pathologists' uncertainty about the presence of the nucleoli, which is often difficult to visualize in formalin-fixed biopsies. We do not find problems comparing the prominent nucleoli in the neoplastic glands with the inconspicuous or delicate nucleoli that may be seen in the adjacent benign glands.Obviously, it is also paramount to deal with other common technical pitfalls, such as thick and overstained sections that obscure the nuclear morphology. High-molecular-weight cytokeratin (34βE12 or keratin 903), which stains the basal cells in prostatic glands, demonstrates variations of sensitivity and specificity, which are dependent on the duration of formalin fixation and the antigen retrieval technique.4 IBF-fixed prostate biopsies demonstrate preserved immunoreactivity for high-molecular-weight cytokeratin (for antibodies 34βE12 and cytokeratin 5/6) and for α-methylacyl-CoA racemase/P504S.5 Sectioning of IBF-fixed biopsies does not require additional time or technical skill in comparison to the similar formalin-fixed small biopsies (eg, liver and lung), and IBF has a comparable cost to formalin. In our experience, in addition to proper handling, processing, sectioning, and staining of the prostate biopsies, fixation in IBF improves the resolution of the cytologic and nuclear detail and preserves the immunoreactivity of the prostate biopsy tissue.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,008
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,023
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Commentaire · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,041

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0080,023
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0020,003
Communication savante0,0040,004
Science ouverte0,0050,001
Intégrité de la recherche0,0090,016
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,005

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,280
Écart entre enseignants0,267 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreCommentaire

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2006
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueArchives of Pathology & Laboratory MedicineMême sujetProstate Cancer Diagnosis and TreatmentTravaux en français237 207