Engineering Micrometer‐Sized DNA Tracks for High‐Speed DNA Synthesis and Biosensing
Notice bibliographique
Résumé
Abstract φ29 DNA polymerase (Polφ29) is capable of synthesizing long‐chain single‐stranded (ss) DNA molecules by copying the sequence of a small ss circular DNA template (ssCDT) in a process known as rolling circle amplification (RCA). The use of a ssCDT in RCA, however, comes with a key drawback: the rate of DNA synthesis is significantly reduced. We hypothesize that this issue can be overcome using a very long linear ssDNA template with a repeating sequence. To test this idea, we engineered a DNA assembly, which we denote “micrometer‐sized DNA track” (μDT). This μDT, with an average length of ≈13.5 μm, is made of a long chain DNA with a primer‐binding domain at its 3′ end and ≈1000 repeating sequence units at its 5′ end, each carrying a DNA anchor. We find that Polφ29 copies μDT at a speed ≈5‐time faster than it does a related ssCDT. We use this to design a simple all‐in‐one printed paper device for rapid and sensitive detection of microRNA let‐7. This paper sensor is capable of detecting 1 pM let‐7a in 10 minutes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».