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Enregistrement W4254328163 · doi:10.3410/f.1029286.343661

Faculty Opinions recommendation of Salmonella pathogenicity island 2 is expressed prior to penetrating the intestine.

2005· dataset· en· W4254328163 sur OpenAlexfundno aff
Francisco Garcı́a-del Portillo

Notice bibliographique

RevueFaculty Opinions – Post-Publication Peer Review of the Biomedical Literature · 2005
Typedataset
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueSalmonella and Campylobacter epidemiology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of British ColumbiaMichael Smith Health Research BCHoward Hughes Medical Institute
Mots-clésPathogenicity islandVirulenceSalmonellaMicrobiologySalmonella entericaBiologyTyphoid feverPathogenesisPathogenIntracellular parasiteIntestinal epitheliumVirulence factorBacteriaImmune systemImmunologyEpitheliumGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Salmonella enterica serovar Typhimurium is a facultative intracellular pathogen that causes disease in mice that resembles human typhoid.Typhoid pathogenesis consists of distinct phases in the intestine and a subsequent systemic phase in which bacteria replicate in macrophages of the liver and spleen.The type III secretion system encoded by Salmonella pathogenicity island 2 (SPI-2) is a major virulence factor contributing to the systemic phase of typhoid pathogenesis.Understanding how pathogens regulate virulence mechanisms in response to the environment, including different host tissues, is key to our understanding of pathogenesis.A recombinase-based in vivo expression technology system was developed to assess SPI-2 expression during murine typhoid.SPI-2 expression was detectable at very early times in bacteria that were resident in the lumen of the ileum and was independent of active bacterial invasion of the epithelium.We also provide direct evidence for the regulation of SPI-2 by the Salmonella transcription factors ompR and ssrB in vivo.Together these results demonstrate that SPI-2 expression precedes penetration of the intestinal epithelium.This induction of expression precedes any documented SPI-2-dependent phases of typhoid and may be involved in preparing Salmonella to successfully resist the antimicrobial environment encountered within macrophages.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,009
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,044
Score d'incertitude au seuil0,148

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,009
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0060,010
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0440,027

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,044
Tête enseignante GPT0,335
Écart entre enseignants0,290 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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