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Enregistrement W4254688893 · doi:10.22215/etd/2015-11003

Functional interactions between TALE and lateral organ boundary transcription factors in regulation of flowering in Arabidopsis thaliana

2015· dissertation· en· W4254688893 sur OpenAlexaff
Brenda Salasini

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typedissertation
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Molecular Biology Research
Établissements canadiensCarleton University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMeristemArabidopsisBiologyInflorescenceArabidopsis thalianaCell biologyHomeoboxTranscription factorPrimordiumBotanyGeneticsGeneShootMutant

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In Arabidopsis (Arabidopsis thaliana), floral inductive signals acting on the shoot apical meristem (SAM) cause acquisition of inflorescence meristem (IM) fate.This process depends on PENNYWISE (PNY) and POUND-FOOLISH (PNF).These factors maintain meristem activity essential for flowering by repressing a lateral organ boundary module comprising BLADE-ON-PETIOLE1/2 (BOP1/2) and its downstream effectors: ARABIDOPSIS THALIANA HOMEOBOX GENE1 (ATH1) and KNOTTED1-LIKE FROM ARABIDOPSIS THALIANA6 (KNAT6).Misexpression of this module in pny pnf apices abolishes flowering but the mechanism was unclear.BOP1/2 are BTB-ankryin transcriptional co-activators that require TGACG motif-binding (TGA) basic leucine zipper (bZIP) proteins for recruitment to DNA.A steroid induction system was used to show that BOP1 directly activates ATH1 but binding sites were unknown.My data pinpoint the location of bZIPbinding elements in a segment of the ATH1 promoter that shows responsiveness to BOP1 induction and provide genetic evidence to show that clade I TGA factors are part of this pathway.I also provide evidence that this module perturbs the cross-talk between gibberellin (GA) and jasmonic acid (JA) pathways to abolish flowering in pny pnf mutants.Collectively, these data shed light on the role of lateral organ boundary genes in flowering.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,275
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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