MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4254820685 · doi:10.24214/jcbps.b.7.4.101136

Few Simple Sequence Repeats in Human Hair

2017· article· en· W4254820685 sur OpenAlexfundno aff

Notice bibliographique

RevueJournal of Chemical Biological and Physical Sciences · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHair Growth and Disorders
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesYork University
Mots-clésSimple (philosophy)Sequence (biology)Computational biologyBiologyComputer scienceGeneticsPhilosophy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Keratin genes are subgroup of intermediate filament (IF) genes. Keratins expressed in hair are called "hair keratins". Comparison of keratin gene sequences and structural organization has been done earlier but no study has been undertaken that compares human hair keratin genes with orthologues in chimp, orangutan, macaque and platypus, with specific references to simple sequence repeats (SSRs) or microsatellites. This study seeks presence of SSRs in human hair keratin genes and compares their positions in orthologue genes. Although the structural organization of keratin genes is largely conserved, as reported in other studies; some human keratin genes show differences in the number of exons and the lengths of exons/introns, when compared with the orthologues. The present study shows few SSRs in human hair keratin genes, where only one repeat is found in exon of Type I keratin gene KRT31, while additional repeats are present in introns. Some repeats are longer in the human genes whereas some indicate reduction in length compared with orthologues. Many repeats are present in regions that are known for intronic variations. This study revisits the comparisons of structural organization of human hair keratin genes and compares them with the orthologues. The SSRs found here could be useful for monitoring variations in human hair keratin genes that may happen due to hypermutable nature of SSRs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,598
Score d'incertitude au seuil0,405

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,090
Tête enseignante GPT0,379
Écart entre enseignants0,289 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Chemical Biological and Physical SciencesMême sujetHair Growth and DisordersTravaux en français237 207