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Enregistrement W4255215605 · doi:10.1021/acs.jpclett.8b02225

Combined Biophysical Chemistry Reveals a New Covalent Inhibitor with a Low-Reactivity Alkyl Halide

2018· article· en· W4255215605 sur OpenAlexafffund
Tang Li, René Maltais, Donald Poirier, Sheng‐Xiang Lin

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Physical Chemistry Letters · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueSynthesis and Characterization of Pyrroles
Établissements canadiensWilfrid Laurier UniversityUniversité LavalCentre hospitalier universitaire de Québec
Organismes subventionnairesInstitute of Cancer ResearchCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésCovalent bondChemistryAlkylReactivity (psychology)EnzymeStereochemistryAlkylationActive siteEnzyme inhibitorCombinatorial chemistryCatalysisBiochemistryOrganic chemistryMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

17β-Hydroxysteroid dehydrogenase type 1 (17β-HSD1) plays a pivotal role in the progression of estrogen-related diseases because of its involvement in the biosynthesis of estradiol (E2), constituting a valuable therapeutic target for endocrine treatment. In the present study, we successfully cocrystallized the enzyme with the reversible inhibitor 2-methoxy-16β-( m -carbamoylbenzyl)-E2 (2-MeO-CC-156) as well as the enzyme with the irreversible inhibitor 3-(2-bromoethyl)-16β-( m -carbamoylbenzyl)-17β-hydroxy-1,3,5(10)-estratriene (PBRM). The structures of ternary complexes of 17β-HSD1–2-MeO-CC-156–NADP + and 17β-HSD1–PBRM–NADP + comparatively show the formation of a covalent bond between His 221 and the bromoethyl side chain of the inhibitor in the PBRM structure. A dynamic process including beneficial molecular interactions that favor the specific binding of a low-reactivity inhibitor and subsequent N-alkylation event through the participation of His 221 in the enzyme catalytic site clearly demonstrates the covalent bond formation. This finding opens the door to a new design of alkyl halide-based specific covalent inhibitors as potential therapeutic agents for different enzymes, contributing to the development of highly efficient inhibitors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,215
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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