Large- Scale Analysis of MicroRNA Expression in Motor Neuron- like Cells derived from Human Umbilical Cord Blood Mesenchymal Stem Cells
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background Motor neuron- related disorders such as Spinal Cord Injuries and Amyotrophic Lateral Sclerosis are extremely common around the world. Many efforts have been made to use stem cells to modulate regeneration of spinal cord damages. Human umbilical cord blood mesenchymal stem cells (CB-MSCs) cover a class of cells with self-renewal feature and multilineage differentiation capacity. Retinoic acid(RA) and sonic hedgehog(Shh) are two morphogens responsible in motorneuron commitment during development. This study aims to explore the effect of Shh and RA on differentiation of CB-MSCs into motor neuron- like cells and to determine the related microRNA profile. To do that, human MSCs were isolated and then characterized using flowcytometry. The cells were induced using RA and Shh and the outcomes were assessed by immunocytochemistry, real-time- PCR, and flowcytometry. MicroRNA analysis was performed using Solexa system at three libraries, including Test 1 (with RA and Shh), Test 2 (After removing RA and Shh) and the Control. Results The isolated cells were spindle shape and could express MSC markers confirmed by flowcytometry. The cells could express motorneuron- related markers including Islet-1, Hb-9, SMI-32 and ChAT at the level of mRNA and protein, when treated with RA and Shh. Two weeks after induction, the expression of Neun and Islet-1 declined. The analysis of miRNA sequencing revealed a significant expression of mir-let-7b, mir-137 and mir-324-5p, which were responsible for neuron/motor neuron differentiation and suppression of neural progenitor cell proliferation. Moreover, some novel microRNAs involved in cholinergic, Jak- Stat, Hedgehog and Map kinase signaling pathways were revealed. Conclusion CB-MSC represents a type of cells with convenient accessibility, which can be differentiated into motor neuron- like cells in the presence of RA and Shh. We could also detect the expression of candid microRNAs responsible in motor neuron differentiation and some novel microRNAs involved in cholinergic, Jak- Stat, Hedgehog and Map kinase signaling pathways that must be functionally evaluated in further studies.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».