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Enregistrement W4255376127 · doi:10.21203/rs.3.rs-16565/v1

Large- Scale Analysis of MicroRNA Expression in Motor Neuron- like Cells derived from Human Umbilical Cord Blood Mesenchymal Stem Cells

2020· preprint· en· W4255376127 sur OpenAlexfundno aff
Davood Sanooghi, Abolfazl Lotfi, Faezeh Faghihi, Afzal Karimi, Zohreh Bagher, Behnam Yousefi, Erfan Lotfi, Mohammad Taghi Joghataei

Notice bibliographique

RevueResearch Square · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicroRNA in disease regulation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCanadian Cancer Society Research InstituteIranian Council of Stem Cell Research and TechnologyIran National Science FoundationIran University of Medical SciencesNational Science Foundation
Mots-clésUmbilical cordMesenchymal stem cellCord liningmicroRNAWharton's jellyCell biologyBiologyStem cellCord bloodPlacenta cord bankingNeuroscienceAdult stem cellImmunologyFetusPlacentaEmbryonic stem cellGeneGeneticsPregnancy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Motor neuron- related disorders such as Spinal Cord Injuries and Amyotrophic Lateral Sclerosis are extremely common around the world. Many efforts have been made to use stem cells to modulate regeneration of spinal cord damages. Human umbilical cord blood mesenchymal stem cells (CB-MSCs) cover a class of cells with self-renewal feature and multilineage differentiation capacity. Retinoic acid(RA) and sonic hedgehog(Shh) are two morphogens responsible in motorneuron commitment during development. This study aims to explore the effect of Shh and RA on differentiation of CB-MSCs into motor neuron- like cells and to determine the related microRNA profile. To do that, human MSCs were isolated and then characterized using flowcytometry. The cells were induced using RA and Shh and the outcomes were assessed by immunocytochemistry, real-time- PCR, and flowcytometry. MicroRNA analysis was performed using Solexa system at three libraries, including Test 1 (with RA and Shh), Test 2 (After removing RA and Shh) and the Control. Results The isolated cells were spindle shape and could express MSC markers confirmed by flowcytometry. The cells could express motorneuron- related markers including Islet-1, Hb-9, SMI-32 and ChAT at the level of mRNA and protein, when treated with RA and Shh. Two weeks after induction, the expression of Neun and Islet-1 declined. The analysis of miRNA sequencing revealed a significant expression of mir-let-7b, mir-137 and mir-324-5p, which were responsible for neuron/motor neuron differentiation and suppression of neural progenitor cell proliferation. Moreover, some novel microRNAs involved in cholinergic, Jak- Stat, Hedgehog and Map kinase signaling pathways were revealed. Conclusion CB-MSC represents a type of cells with convenient accessibility, which can be differentiated into motor neuron- like cells in the presence of RA and Shh. We could also detect the expression of candid microRNAs responsible in motor neuron differentiation and some novel microRNAs involved in cholinergic, Jak- Stat, Hedgehog and Map kinase signaling pathways that must be functionally evaluated in further studies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,332
Écart entre enseignants0,300 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
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