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Enregistrement W4255915421 · doi:10.1002/9781118960608.gbm00525

<i>Fibrobacter</i>

2015· other· en· W4255915421 sur OpenAlexaff
Anne M. Spain, Cecil W. Forsberg, Lee R. Krumholz

Notice bibliographique

RevueBergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria · 2015
Typeother
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueBiofuel production and bioconversion
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFibrobacter succinogenesFermentationBiochemistryCellobioseMaltoseLactoseChemistryBiologyRumenCelluloseCellulaseEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Fi'bro.bac'ter. L. fem. n. fibra fiber or filament in plants or animals; N.L. masc. n. bacter rod or staff; N.L. masc n. Fibrobacter bacterial rod that subsists on fiber. Cells are rod‐shaped (0.3–0.5 µm × 0.8–1.6 µm) or ovoid (0.8–1.6 µm × 0.8–1.6 µm). Obligately anaerobic non‐sporing and not detectably motile by microscopy. They are able to migrate through agar when growing on cellulose, suggesting a gliding form of motility. Ferment a narrow range of carbohydrates including glucose, cellobiose, and cellulose. Other sugars including lactose or maltose are fermented by a few species. The fermentation products are acetate and succinate, and sometimes formate at low levels. Cells require CO 2 , straight‐chain and branched‐chain fatty acids in the media as well as ammonia as the N source. Membranes are composed of straight‐chain fatty acids, and phospholipids are predominantly ethanolamine plasmalogens. Habitat is the mammalian gastrointestinal tract. DNA G + C content ( mol %): 45–51. Type species : Fibrobacter succinogenes Montgomery, Flesher and Stahl 1988, 434 VP . Taxonomic and Nomenclature Notes According to the List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), the taxonomic status of the genus Fibrobacter is: correct name (last update, February 2025) * . LPSN classification: Bacteria / Pseudomonadati / Fibrobacterota / Fibrobacteria / Fibrobacterales / Fibrobacteraceae / Fibrobacter The genus Fibrobacter can also be recovered in the Genome Taxonomy Database (GTDB) as g__Fibrobacter (version v220) ** . GTDB classification: d__Bacteria / p__Fibrobacterota / c__Fibrobacteria / o__Fibrobacterales / f__Fibrobacteraceae / g__Fibrobacter * Meier‐Kolthoff et al. ( 2022 ). Nucleic Acids Res , 50 , D801 – D807 ; DOI: 10.1093/nar/gkab902 ** Parks et al. ( 2022 ). Nucleic Acids Res , 50 , D785 – D794 ; DOI: 10.1093/nar/gkab776

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: Autre
Score de désaccord entre enseignants0,189
Score d'incertitude au seuil0,858

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,213
Écart entre enseignants0,202 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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