Gene-expression profiling of calves 6 and 9 months after inoculation with Mycobacterium avium subspecies paratuberculosis
Notice bibliographique
Résumé
Early detection of Johne's disease (JD) caused by Mycobacterium avium subspecies paratuberculosis (MAP) is essential to reduce transmission; consequently, new diagnostic techniques and approaches to detect MAP or markers of early MAP infection are being explored. The objective was to identify biomarkers associated with MAP infection at 6 and 9 months after oral inoculation. Therefore, gene expression analysis was done using whole blood cells obtained from MAP-infected calves. All MAP-inoculated calves had a cell-mediated immune response (IFN-γ) to Johnin PPD specific antigens, and 60% had an antibody response to MAP antigens. Gene expression analysis at 6 months after inoculation revealed downregulation of chemoattractants, namely neutrophil beta-defensin-9 like peptide (BNBD9-Like), S100 calcium binding protein A9 (s100A9) and G protein coupled receptor 77 (GPR77) or C5a anaphylatoxin chemotactic receptor (C5a2). Furthermore, BOLA/MHC-1 intracellular antigen presentation gene was downregulated 9 months after inoculation. In parallel, qPCR experiments to evaluate the robustness of some differentially expressed genes revealed consistent downregulation of BOLA/MHC-I, BNBD9-Like and upregulation of CD46 at 3, 6, 9, 12, and 15 months after inoculation. In conclusion, measuring the expression of these genes has potential for implementation in a diagnostic tool for the early detection of MAP infection.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».