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Enregistrement W4256453127 · doi:10.1158/1538-7445.am10-2226

Abstract 2226: International Cancer Genome Consortium (ICGC)

2010· article· en· W4256453127 sur OpenAlexaffabout
Jennifer L. Jennings, Thomas J. Hudson

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA modifications and cancer
Établissements canadiensOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCancerGovernment (linguistics)Library scienceMedicinePolitical scienceInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The International Cancer Genome Consortium (ICGC) is one of most ambitious biomedical research efforts since the Human Genome Project. The ICGC is coordinating an international-scale research effort to obtain a comprehensive description of genomic, transcriptomic and epigenomic changes in the major forms of cancer. This information will lead to better ways of diagnosing, treating and preventing cancer. The ICGC was launched in April 2008, with the announcement of the proposed strategies and policies to the international scientific community to enable funding agencies and research groups to plan their participation within the ICGC. As of December 2009, the ICGC has received commitments from funding organizations in Asia, Australia, Europe and North America for the following cancer genome projects: breast cancer, Her2+ (France); breast cancer, multiple subtypes (United Kingdom); chronic lymphocytic leukemia (Spain); gastric adenocarcinoma (China), hepatocellular carcinoma, alcohol and associated etiologies (France); pediatric brain cancers - medulloblastoma and pilocytic astrocytoma (Germany); hepatocellular carcinoma, viral etiologies (Japan); oral cavity cancer (India), and pancreatic adenocarcinoma (Australia and Canada). Furthermore, the latest call for proposals published in the Health Theme of the European Union's 7th Research Framework Programme includes a research topic to support European participation in the ICGC. The ICGC projects will complement a large US-based pilot project called The Cancer Genome Atlas, which oversees projects related to glioblastoma multiforme, squamous carcinoma and serous adenocarcinoma. Over time, additional nations and organizations Each project is expected to involve specimens from approximately 500 patients. Over the next ten years, the ICGC expects to produce comprehensive catalogues of the full range of genetic mutations involved in 50 types of cancer, with key factors being the ability to detect all mutated cancer genes, data at the level of individual DNA bases, application of common standards for pathology and technology and comparison data from matched, non-tumour tissue. The ICGC's informed consent and ethical oversight policies state that cancer patients enrolled in an ICGC-related study should be informed that their participation is voluntary, that their clinical care will not be affected by their participation and that data obtained from analyses using their samples will be made available to the international research community. ICGC projects will use common standards of data collection and analysis. The ICGC will make its data rapidly and freely available to the global research community. Citation Format: {Authors}. {Abstract title} [abstract]. In: Proceedings of the 101st Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2010 Apr 17-21; Washington, DC. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2010;70(8 Suppl):Abstract nr 2226.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,015
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,024
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,094
Score d'incertitude au seuil0,315

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0150,024
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0050,011
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0060,002
Science ouverte0,0050,005
Intégrité de la recherche0,0060,005
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0940,036

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,064
Tête enseignante GPT0,419
Écart entre enseignants0,356 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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