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Enregistrement W4280488965 · doi:10.1038/s41586-022-04865-0

Limited cross-variant immunity from SARS-CoV-2 Omicron without vaccination

2022· article· en· W4280488965 sur OpenAlexfundno aff
Rahul K. Suryawanshi, Irene P. Chen, Tongcui Ma, Abdullah M. Syed, Noah Brazer, Prachi Saldhi, Camille R. Simoneau, Alison Ciling, Mir M. Khalid, Bharath Sreekumar, Peiyi Chen, G. Renuka Kumar, Mauricio Montaño, Ronne Gascon, Chia-Lin Tsou, Miguel Garcia-Knight, Alicia Sotomayor-González, Venice Servellita, Amelia S. Gliwa, Jenny Nguyen, Inês Silva, Bilal Milbes, Noah Kojima, Victoria Hess, Maria Shacreaw, Lauren Lopez, Matthew Brobeck, Fred Turner, Frank Soveg, Ashley F. George, Xiaohui Fang, Mazharul Maishan, Michael A. Matthay, Mary Kate Morris, Debra A. Wadford, Carl V. Hanson, Warner C. Greene, Raul Andino, Lee Spraggon, Nadia R. Roan, Charles Y. Chiu, Jennifer A. Doudna, Mélanie Ott

Notice bibliographique

RevueNature · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 and COVID-19 Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Heart, Lung, and Blood InstituteUniversity of California, San FranciscoRoddenberry FoundationMercatus Center, George Mason UniversityFast GrantsNational Institutes of HealthInnovative Genomics InstituteGladstone InstitutesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaAbbott LaboratoriesGeorge Mason UniversityCenters for Disease Control and PreventionNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesHoward Hughes Medical Institute
Mots-clésNeutralizationVaccinationImmunityVirologyImmune systemBiologySevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)ImmunologyCoronavirus disease 2019 (COVID-19)DiseaseMedicineVirusInfectious disease (medical specialty)Pathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract SARS-CoV-2 Delta and Omicron are globally relevant variants of concern. Although individuals infected with Delta are at risk of developing severe lung disease, infection with Omicron often causes milder symptoms, especially in vaccinated individuals 1,2 . The question arises of whether widespread Omicron infections could lead to future cross-variant protection, accelerating the end of the pandemic. Here we show that without vaccination, infection with Omicron induces a limited humoral immune response in mice and humans. Sera from mice overexpressing the human ACE2 receptor and infected with Omicron neutralize only Omicron, but not other variants of concern, whereas broader cross-variant neutralization was observed after WA1 and Delta infections. Unlike WA1 and Delta, Omicron replicates to low levels in the lungs and brains of infected animals, leading to mild disease with reduced expression of pro-inflammatory cytokines and diminished activation of lung-resident T cells. Sera from individuals who were unvaccinated and infected with Omicron show the same limited neutralization of only Omicron itself. By contrast, Omicron breakthrough infections induce overall higher neutralization titres against all variants of concern. Our results demonstrate that Omicron infection enhances pre-existing immunity elicited by vaccines but, on its own, may not confer broad protection against non-Omicron variants in unvaccinated individuals.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,369
Écart entre enseignants0,338 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations213
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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