MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4280493960 · doi:10.1186/s12896-022-00744-8

Introduction of loxP sites by electroporation in the mouse genome; a simple approach for conditional allele generation in complex targeting loci

2022· article· en· W4280493960 sur OpenAlex
Guillaume Bernas, Mariette Ouellet, Andréa Barrios, Hélène Jamann, Catherine Larochelle, Émile Lévy, Jean-François Schmouth

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueBMC Biotechnology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCRISPR and Genetic Engineering
Établissements canadiensUniversité de MontréalCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesUniversity of California, IrvineMultiple Sclerosis SocietyMultiple Sclerosis Society of CanadaEuropean Genomic Institute for Diabetes
Mots-clésBiologyCre-Lox recombinationElectroporationAlleleGeneticsGenomeComputational biologySimple (philosophy)GeneTransgene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The discovery of the CRISPR-Cas9 system and its applicability in mammalian embryos has revolutionized the way we generate genetically engineered animal models. To date, models harbouring conditional alleles (i.e. two loxP sites flanking an exon or a critical DNA sequence of interest) are amongst the most widely requested project type that are challenging to generate as they require simultaneous cleavage of the genome using two guides in order to properly integrate the repair template. An approach, using embryo sequential electroporation has been reported in the literature to successfully introduce loxP sites on the same allele. Here, we describe a modification of this sequential electroporation procedure that demonstrated the production of conditional allele mouse models for eight different genes via one of two possible strategies: either by consecutive sequential electroporation (strategy A) or non-consecutive sequential electroporation (strategy B). This latest strategy originated from using the by-product produced when using consecutive sequential electroporation (i.e. mice with a single targeted loxP site) to complete the project. RESULTS: By using strategy A, we demonstrated successful generation of conditional allele models for three different genes (Icam1, Lox, and Sar1b), with targeting efficiencies varying between 5 and 13%. By using strategy B, we generated five conditional allele models (Loxl1, Pard6a, Pard6g, Clcf1, and Mapkapk5), with targeting efficiencies varying between 3 and 25%. CONCLUSION: Our modified electroporation-based approach, involving one of the two alternative strategies, allowed the production of conditional allele models for eight different genes via two different possible paths. This reproducible method will serve as another reliable approach in addition to other well-established methodologies in the literature for conditional allele mouse model generation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,390
Score d'incertitude au seuil0,310

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,264
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle