Genomic and Phenotypic Insights into the Potential of Bacillus subtilis YB-15 Isolated from Rhizosphere to Biocontrol against Crown Rot and Promote Growth of Wheat
Notice bibliographique
Résumé
Fusarium crown rot caused by Fusarium pseudograminearum is one of the most devastating diseases of wheat worldwide causing major yield and economic losses. In this study, strain YB-15 was isolated from soil of wheat rhizosphere and classified as Bacillus subtilis by average nucleotide identity analysis. It significantly reduced Fusarium crown rot with a control efficacy of 81.50% and significantly improved the growth of wheat seedlings by increasing root and shoot fresh weight by 11.4% and 4.2%, respectively. Reduced Fusarium crown rot may have been due to direct antagonism by the production of β-1, 3-glucanase, amylase, protease and cellulase, or by the ability of B. subtilis YB-15 to induce defense-related enzyme activities of wheat seedlings, both alone and in seedlings infected with F. pseudograminearum. Improved plant growth may be related to the ability of B. subtilis YB-15 to secrete indole acetic acid and siderophores, as well as to solubilize phosphorus. In addition, the genome of strain YB-15 was determined, resulting in a complete assembled circular genome of 4,233,040 bp with GC content of 43.52% consisting of 4207 protein-encoding genes. Sequencing the B. subtilis YB-15 genome further revealed genes for encoding carbohydrate-active enzymes, biosynthesis of various secondary metabolites, nutrient acquisition, phytohormone production, chemotaxis and motility, which could explain the potential of strain YB-15 to be plant growth-promoting bacteria and biological control agent. B. subtilis YB-15 appears to be a promising biocontrol agent against Fusarium crown rot as well as for wheat growth promotion.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».