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Enregistrement W4280510411 · doi:10.1002/ar.24955

Localization of host endocytic and actin‐associated proteins during <i>Shigella flexneri</i> intracellular motility and intercellular spreading

2022· article· en· W4280510411 sur OpenAlexafffund
Aaron S. Dhanda, Julian A. Guttman

Notice bibliographique

RevueThe Anatomical Record · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEscherichia coli research studies
Établissements canadiensSimon Fraser University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésShigella flexneriEndocytic cycleCell biologyActin cytoskeletonActinBiologyCytoskeletonEndocytosisCellBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Shigella flexneri (S. flexneri), the causative agent of bacillary dysentery, uses an effector-mediated strategy to hijack host cells and cause disease. To propagate and spread within human tissues, S. flexneri bacteria commandeer the host actin cytoskeleton to generate slender actin-rich comet tails to move intracellularly, and later, plasma membrane actin-based protrusions to move directly between adjacent host cells. To facilitate intercellular bacterial spreading, large micron-sized endocytic-like membrane invaginations form at the periphery of neighboring host cells that come into contact with S. flexneri-containing membrane protrusions. While S. flexneri comet tails and membrane protrusions consist primarily of host actin cytoskeletal proteins, S. flexneri membrane invaginations remain poorly understood with only clathrin and the clathrin adapter epsin-1 localized to the structures. Tangentially, we recently reported that Listeria monocytogenes, another actin-hijacking pathogen, exploits an assortment of caveolar and actin-bundling proteins at their micron-sized membrane invaginations formed during their cell-to-cell movement. Thus, to further characterize the S. flexneri disease process, we set out to catalog the distribution of a variety of actin-associated and caveolar proteins during S. flexneri actin-based motility and cell-to-cell spreading. Here we show that actin-associated proteins found at L. monocytogenes comet tails and membrane protrusions mimic those present at S. flexneri comet tails with the exception of α-actinins 1 and 4, which were shed from S. flexneri membrane protrusions. We also demonstrate that all known host endocytic components found at L. monocytogenes membrane invaginations are also present at those formed during S. flexneri infections.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,016
Score d'incertitude au seuil0,394

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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