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Enregistrement W4280514134 · doi:10.1063/5.0094771

Coronavirus pleomorphism

2022· article· en· W4280514134 sur OpenAlexafffund
M. A. Kanso, M. Naime, V. Chaurasia, Khemapat Tontiwattanakul, Eliot Fried, A. Jeffrey Giacomin

Notice bibliographique

RevuePhysics of Fluids · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 and COVID-19 Research
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMitacsCanada Research ChairsGovernment of Canada
Mots-clésProlate spheroidOblate spheroidPhysicsCapsidThermal diffusivityClassical mechanicsVirologyVirusQuantum mechanicsBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The coronavirus is always idealized as a spherical capsid with radially protruding spikes. However, histologically, in the tissues of infected patients, capsids in cross section are elliptical, and only sometimes spherical [Neuman et al., “Supramolecular architecture of severe acute respiratory syndrome coronavirus revealed by electron cryomicroscopy,” J Virol, 80, 7918 (2006)]. This capsid ellipticity implies that coronaviruses are oblate or prolate or both. We call this diversity of shapes, pleomorphism. Recently, the rotational diffusivity of the spherical coronavirus in suspension was calculated, from first principles, using general rigid bead-rod theory [Kanso et al., “Coronavirus rotational diffusivity,” Phys Fluids 32, 113101 (2020)]. We did so by beading the spherical capsid and then also by replacing each of its bulbous spikes with a single bead. In this paper, we use energy minimization for the spreading of the spikes, charged identically, over the oblate or prolate capsids. We use general rigid bead-rod theory to explore the role of such coronavirus cross-sectional ellipticity on its rotational diffusivity, the transport property around which its cell attachment revolves. We learn that coronavirus ellipticity drastically decreases its rotational diffusivity, be it oblate or prolate.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,420
Score d'incertitude au seuil0,344

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,091
Tête enseignante GPT0,373
Écart entre enseignants0,281 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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