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Enregistrement W4280516697 · doi:10.1042/bsr20220040

Commentary on: SMARCB1 as a novel diagnostic and prognostic biomarker for osteosarcoma

2022· article· en· W4280516697 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueBioscience Reports · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueChromatin Remodeling and Cancer
Établissements canadiensChildren's Hospital of Eastern OntarioUniversity of AlbertaUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSMARCB1BiologyCancer researchBiomarkerGene expressionGeneGeneticsChromatin remodeling

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In the last couple of decades, biomarkers have been on the rise for diagnostic and predictive value. There has been a rush to identify new markers using new technologies and drug repurposing approaches. SMARCB1 acronym arises from the SWI/SNF (SWItch/Sucrose Non-Fermentable)-related Matrix-associated Actin-dependent Regulator of Chromatin subfamily B member 1 (SMARCB1). It is a molecule, whose role is associated with the sucrose metabolism. SMARCB1 is also called INI1 (Integrase Interactor 1). The molecule was discovered in the mid-1990s. Its role as a loss-of-function marker for malignant rhabdoid tumors (MRT) of renal and extrarenal origin has enormously expanded the spectrum of involved neoplasms since that time. Several tumors have been characterized by genetic aberrations in the SMARCB1 gene. They include reduction in expression, loss of expression, and mosaic expression. Most of the tumors are sarcomas, but a variegated group of tumors with mixed phenotypes has also been delineated. It is well known that the outcome of patients harboring genetic aberrations in the SMARCB1 gene has been poor. Guo et al. reported that reduced SMARCB1 expression occurred in 70% of osteosarcomas. Their data significantly correlated with poor neoadjuvant response. These authors emphasize a shorter progression-free and overall survival of the patients demonstrating an altered expression of this gene. Interestingly, mRNA in silico analysis established that SMARCB1 expression correlates with the response to chemotherapy of osteosarcoma patients, but there was no reliable correlation between SMARCB1 expression level and metastasis, response to neoadjuvant therapy, overall survival, and progression-free survival. The study involved a tissue microarray (TMA) on bone tumors that may limit the full evaluation of the gene expression. Nevertheless, Guo et al.'s study is remarkable. It expands the list of the tumors harboring an altered SMARCB1 gene expression and suggests that this marker should be investigated in every pathology workup for potential predictive value. On the other side, much work needs to be done if we hope that we strive to provide additional therapeutic strategies for osteosarcoma patients with altered SMARCB1 gene expression.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,752
Score d'incertitude au seuil0,438

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,278
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle