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Enregistrement W4280516745 · doi:10.1038/s41589-022-01024-4

PRMT inhibition induces a viral mimicry response in triple-negative breast cancer

2022· article· en· W4280516745 sur OpenAlexafffund
Wail Ba-alawi, YiShuai Ji, ZiWen Zhang, Jennifer Cruickshank, Jillian Haight, Felipe E. Ciamponi, Jocelyn Chen, Shili Duan, Yudao Shen, Jing Liu, Sajid A. Marhon, Parinaz Mehdipour, Magdalena M. Szewczyk, Nergiz Doğan, Wenjun Chen, Lan-Xin Zhang, Geneviève Deblois, Panagiotis Prinos, Katlin B. Massirer, Dalia Baršytė-Lovejoy, Jian Jin, Daniel D. De Carvalho, Benjamin Haibe‐Kains, Xiaojia Wang, David W. Cescon, Mathieu Lupien, C.H. Arrowsmith

Notice bibliographique

RevueNature Chemical Biology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related gene regulation
Établissements canadiensVector InstituteOntario Institute for Cancer ResearchUniversité de MontréalStructural Genomics ConsortiumPrincess Margaret Cancer CentreUniversity Health NetworkUniversity of TorontoInstitute for Research in Immunology and Cancer
Organismes subventionnairesNatural Science Foundation of Zhejiang ProvinceCanadian Institutes of Health ResearchChinese Academy of SciencesGenentechNational Natural Science Foundation of ChinaOntario Genomics InstituteEuropean Federation of Pharmaceutical Industries and AssociationsMerck KGaAOntario GenomicsFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São PauloGenome CanadaBayerInternational Business Machines CorporationEuropean CommissionPrincess Margaret Cancer FoundationPfizerBristol-Myers Squibb
Mots-clésTriple-negative breast cancerBiomarkerBiologyCancer researchBreast cancerCancerMechanism (biology)Genetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Triple-negative breast cancer (TNBC) is the most aggressive breast cancer subtype with the worst prognosis and few effective therapies. Here we identified MS023, an inhibitor of type I protein arginine methyltransferases (PRMTs), which has antitumor growth activity in TNBC. Pathway analysis of TNBC cell lines indicates that the activation of interferon responses before and after MS023 treatment is a functional biomarker and determinant of response, and these observations extend to a panel of human-derived organoids. Inhibition of type I PRMT triggers an interferon response through the antiviral defense pathway with the induction of double-stranded RNA, which is derived, at least in part, from inverted repeat Alu elements. Together, our results represent a shift in understanding the antitumor mechanism of type I PRMT inhibitors and provide a rationale and biomarker approach for the clinical development of type I PRMT inhibitors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,265
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations122
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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