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Enregistrement W4280536753 · doi:10.4155/bio-2022-0080

2021 White Paper on Recent Issues in Bioanalysis: ISR for Biomarkers, Liquid Biopsies, Spectral Cytometry, Inhalation/Oral &amp; Multispecific Biotherapeutics, Accuracy/LLOQ for Flow Cytometry ( <u>Part 2</u> – Recommendations on Biomarkers/CDx Assays Development &amp; Validation, Cytometry Validation &amp; Innovation, Biotherapeutics PK LBA Regulated Bioanalysis, Critical Reagents &amp; Positive Controls Generation)

2022· article· en· W4280536753 sur OpenAlexaff
Sarah Hersey, Steve Keller, Joel Mathews, Lindsay King, Abbas Bandukwala, Flora Berisha, Mary Birchler, Joe Bower, Valerie A. Clausen, José M. Duarte, Fabio Garofolo, Shirley Hopper, Sumit Kar, Omar S. Mabrouk, Jean‐Claude Marshall, Kristina McGuire, Michael Naughton, Yoshiro Saito, Imelda Schuhmann, Gizette Sperinde, Priscila Camillo Teixeira, Alessandra Vitaliti, Yow‐Ming Wang, Richard Wnek, Yan Zhang, Sue Spitz, Vilma Decman, Steven Eck, Jose Estevam, Polina Goihberg, Enrique Gómez Alcaide, Christèle Gonneau, Michael N. Hedrick, Gregory Hopkins, Fabian Junker, Sandra Nuti, Ülrike Sommer, Nathan Standifer, Chad Stevens, Erin Stevens, Carrie A. Hendricks, Meenu Wadhwa, Albert Torri, Mark Ma, Shannon Harris, Seema Kumar, Michael A. Partridge, Teresa Caiazzo, Shannon Chilewski, Isabelle Cludts, Kelly Coble, Boris Gorovits, Christine Grimaldi, Gregor Jordan, John Kamerud, Beth Leary, Meina Liang, Hanjo Lim, Andrew P. Mayer, Ellen O’Connor, Nisha Palackal, Johann Poetzl, Sandra Prior, Mohsen Rajabi Abhari, Natasha Savoie, Catherine Soo, Mark Ware, Bonnie Wu, Yang Xu, Tong‐Yuan Yang, Jad Zoghbi

Notice bibliographique

RevueBioanalysis · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueBiosensors and Analytical Detection
Établissements canadiensHealth Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBioanalysisContext (archaeology)Medical physicsMass cytometryMedicineBiomarkerChemistryBiologyChromatography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The 15th edition of the Workshop on Recent Issues in Bioanalysis (15th WRIB) was held on 27 September to 1 October 2021. Even with a last-minute move from in-person to virtual, an overwhelmingly high number of nearly 900 professionals representing pharma and biotech companies, contract research organizations (CROs), and multiple regulatory agencies still eagerly convened to actively discuss the most current topics of interest in bioanalysis. The 15th WRIB included three Main Workshops and seven Specialized Workshops that together spanned 1 week in order to allow exhaustive and thorough coverage of all major issues in bioanalysis, biomarkers, immunogenicity, gene therapy, cell therapy and vaccines. Moreover, in-depth workshops on biomarker assay development and validation (BAV) (focused on clarifying the confusion created by the increased use of the term "context of use" [COU]); mass spectrometry of proteins (therapeutic, biomarker and transgene); state-of-the-art cytometry innovation and validation; and critical reagent and positive control generation were the special features of the 15th edition. This 2021 White Paper encompasses recommendations emerging from the extensive discussions held during the workshop, and is aimed to provide the bioanalytical community with key information and practical solutions on topics and issues addressed, in an effort to enable advances in scientific excellence, improved quality and better regulatory compliance. Due to its length, the 2021 edition of this comprehensive White Paper has been divided into three parts for editorial reasons. This publication (Part 2) covers the recommendations on ISR for Biomarkers, Liquid Biopsies, Spectral Cytometry, Inhalation/Oral & Multispecific Biotherapeutics, Accuracy/LLOQ for Flow Cytometry. Part 1A (Endogenous Compounds, Small Molecules, Complex Methods, Regulated Mass Spec of Large Molecules, Small Molecule, PoC), Part 1B (Regulatory Agencies' Inputs on Bioanalysis, Biomarkers, Immunogenicity, Gene & Cell Therapy and Vaccine) and Part 3 (TAb/NAb, Viral Vector CDx, Shedding Assays; CRISPR/Cas9 & CAR-T Immunogenicity; PCR & Vaccine Assay Performance; ADA Assay Comparability & Cut Point Appropriateness) are published in volume 14 of Bioanalysis, issues 9 and 11 (2022), respectively.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,015
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,018
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,985
Score d'incertitude au seuil0,348

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0150,018
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0030,002
Études des sciences et des technologies0,0020,002
Communication savante0,0080,005
Science ouverte0,0040,003
Intégrité de la recherche0,0150,009
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,1040,149

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,060
Tête enseignante GPT0,327
Écart entre enseignants0,267 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
DomaineMéthodes
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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