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Enregistrement W4280549529 · doi:10.1007/s10162-022-00850-6

MicroRNA Signature and Cellular Characterization of Undifferentiated and Differentiated House Ear Institute-Organ of Corti 1 (HEI-OC1) Cells

2022· article· en· W4280549529 sur OpenAlex
Printha Wijesinghe, Desmond A. Nunez, Cathie Garnis

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueJournal of the Association for Research in Otolaryngology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueHearing, Cochlea, Tinnitus, Genetics
Établissements canadiensOccupational Cancer Research CentreStornoway Diamond (Canada)Vancouver General HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesVancouver Coastal Health Research InstituteFondation Pour l'Audition
Mots-clésBiologyCell biologymicroRNAOrgan of CortiPermissiveMAPK/ERK pathwayGeneGeneticsKinaseCochleaNeuroscience

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract MicroRNAs (miRNAs) regulate gene expressions and control a wide variety of cellular functions. House Ear Institute-Organ of Corti 1 (HEI-OC1) cells are widely used to screen ototoxic drugs and to investigate cellular and genetic alterations in response to various conditions. HEI-OC1 cells are almost exclusively studied under permissive conditions that promote cell replication at the expense of differentiation. Many researchers suggest that permissive culture condition findings are relevant to understanding human hearing disorders. The mature human cochlea however consists of differentiated cells and lacks proliferative capacity. This study therefore aimed to compare the miRNA profiles and cellular characteristics of HEI-OC1 cells cultured under permissive (P-HEI-OC1) and non-permissive (NP-HEI-OC1) conditions. A significant increase in the level of expression of tubulin β1 class VI (Tubb1) , e-cadherin (Cdh1), espin (Espn), and SRY (sex determining region Y)-box2 (Sox2) mRNAs was identified in non-permissive cells compared with permissive cells ( P < 0.05, Kruskal–Wallis H test, 2-sided). miR-200 family, miR-34b/c, and miR-449a/b functionally related cluster miRNAs, rodent-specific maternally imprinted gene Sfmbt2 intron 10 th cluster miRNAs (-466a/ -467a), and miR-17 family were significantly ( P < 0.05, Welch’s t -test, 2-tailed) differentially expressed in non-permissive cells when compared with permissive cells. Putative target genes were significantly predominantly enriched in mitogen-activated protein kinase (MAPK), epidermal growth factor family of receptor tyrosine kinases (ErbB), and Ras signaling pathways in non-permissive cells compared with permissive cells. This distinct miRNA signature of differentiated HEI-OC1 cells could help in understanding miRNA-mediated cellular responses in the adult cochlea.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,211
Score d'incertitude au seuil0,374

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,056
Tête enseignante GPT0,314
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle