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Enregistrement W4280560245 · doi:10.3389/fimmu.2022.754383

High-Frequency Notable HBV Mutations Identified in Blood Donors With Occult Hepatitis B Infection From Heyuan City of Southern China

2022· article· en· W4280560245 sur OpenAlexfundno aff
Xianlin Ye, Lihua Liu, Lina Chen, Xianghui Nie, Lu Huang, Denghuang Ye, Jinfeng Zeng, Tong Li, Bin Li, Min Xu, Limin Chen

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Immunology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHepatitis B Virus Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesChinese Academy of Medical Sciences Initiative for Innovative MedicineNational Key Research and Development Program of ChinaUniversity of TorontoCanadian Blood Services
Mots-clésHBsAgGenotypeVirologyGenotypingHepatitis B virusBiologyNested polymerase chain reactionPolymerase chain reactionVirusGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: All Chinese blood centers have implemented mini pool (MP) HBV nucleic acid testing (NAT) together with HBsAg ELISA in routine donor screening since 2015. The prevalence of occult hepatitis B virus infection (OBI) in donors from different regions varies, and the molecular characterization of the HBV DNA and clinical outcomes of these OBIs remain largely unexplored. Methods: Blood donations from Heyuan city in Southern China were screened by HBsAg ELISA and HBV MP8 NAT. Donations with HBsAg-/HBV DNA+ were collected for this study. Molecular characterizations of HBV DNAs were further analyzed by various DNA amplification assays including quantitative PCR (qPCR) and nested PCR, amplifying the basic core and pre-core promoter regions (BCP/PC). The HBsAg (S) region from HBV DNA was isolated by high-volume nucleic acid extraction. Notable mutations were identified by comparison to the HBV reference sequences. The clinical outcomes of the donors with OBIs were further followed for nearly 3 years. Results: Seventy OBIs from 44,592 donations (0.15%) that we identified and reported previously were enrolled for this current study. HBV sequences were obtained from 44/70 OBIs, and genotyping analysis showed that 42/44 (95.2%) OBIs were genotype B, and 2/44 (4.8%) were genotype C. Interestingly, mutation analysis revealed that various mutations including M133L/T, F134L, P142L, V168A, R169H, S174N, L175S, and V177A of HBV DNA affecting HBsAg detection were observed in genotype B OBIs. Two notable mutations, T47K and L53S, were identified in genotype C OBIs. Follow-up studies showed that 3/31 (9.7%) OBIs converted to HBsAg+ as chronic infections while 1/31 (3.2%) HBV DNA was undetectable (classified as recovery) and 27/31 (87.1%) remained as OBIs. Conclusion: Various notable mutations affecting HBsAg detection were observed in blood donors with OBIs in Heyuan city of Southern China. Follow-up studies showed that most OBIs remained as OBIs with fluctuating or low viral loads. Higher sensitive HBV ID NAT is recommended for donor screening to further reduce the transmission risk of OBIs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,015
Score d'incertitude au seuil0,029

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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