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Enregistrement W4280561623 · doi:10.1111/are.15896

Autophagy‐related gene regulation in liver and muscle of rainbow trout ( <i>Oncorhynchus mykiss</i> ) upon exposure to chloroquine, deoxynivalenol and nutrient restriction

2022· article· en· W4280561623 sur OpenAlexafffund
Jaramar Balmori‐Cedeño, Phuc H. Pham, Juan‐Ting Liu, Ehab Misk, Ian Ryerse, Sam Renshaw, Joseph P. Nowlan, John J. Lumsden, John S. Lumsden

Notice bibliographique

RevueAquaculture Research · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAutophagy in Disease and Therapy
Établissements canadiensUniversity of GuelphMowi (Canada)
Organismes subventionnairesOntario Veterinary College, University of GuelphNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaOntario Ministry of Agriculture, Food and Rural Affairs
Mots-clésRainbow troutBiologyAutophagyATG12ATG5Internal medicineEndocrinologyAnimal scienceBiochemistryFisheryApoptosisFish <Actinopterygii>

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Autophagy is important for maintaining homeostasis, nutrient availability and muscle mass in fish. The effect of chloroquine (CQ) and deoxynivalenol (DON) on autophagy-related gene (Atg) regulation was examined in rainbow trout fed with either CQ or DON and compared with pair-fed (nutrient restriction [NR]) and optimally-fed group. Rainbow trout were divided into four groups and, respectively, fed optimal diet (control), diet-containing CQ (6 mg/g), diet-containing DON (0.005 mg/g) or pair-fed the control diet. On days 0, 1, 3, 7, 14 and 21, liver and muscle were sampled to evaluate the expression of atg4, atg5, atg7, atg12, atg13, atg16, bec-1, gabarap and lc3. In both liver and muscle, CQ induced the highest number of Atgs, with eight in liver and seven in muscle; DON-induced six Atgs in liver and three in muscle; and pair-fed induced three Atgs in liver and two in muscle. In vitro, the effect of NR and CQ on Atg was examined in the RTL-W1 cell line. NR induced all Atg in RTL-W1, with the exception of bec-1. Furthermore, NR combined with CQ enhanced Atg expression greater than NR alone. Overall, CQ and DON can modulate Atg in rainbow trout, which can influence physiology and growth in aquaculture.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,862
Score d'incertitude au seuil0,551

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,314
Écart entre enseignants0,287 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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