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Enregistrement W4280566639 · doi:10.3390/microorganisms10051039

Elevated Seawater Temperature and Infection with Neoparamoeba perurans Exacerbate Complex Gill Disease in Farmed Atlantic Salmon (Salmo salar) in British Columbia, Canada

2022· article· en· W4280566639 sur OpenAlexafffundabout
Simon R. M. Jones, Derek Price

Notice bibliographique

RevueMicroorganisms · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueAquaculture disease management and microbiota
Établissements canadiensFisheries and Oceans Canada
Organismes subventionnairesFisheries and Oceans Canada
Mots-clésSalmoBiologyFish farmingFisheryAquacultureSeawaterSalinityGillVeterinary medicineFish <Actinopterygii>EcologyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Gill disorders and diseases are emergent health concerns affecting marine-farmed salmon, for which the causal factors are poorly understood in British Columbia (BC), Canada. This study sought to describe and compare spatial and temporal patterns of infection with Neoparamoeba perurans, the causal agent of amoebic gill disease, and visually assessed gill health scores in farmed Atlantic salmon. Gill tissue obtained during the Fisheries and Oceans Canada’s Fish Health Audit and Intelligence Program (DFO-FHAIP) between 2016 and 2020 were screened for N. perurans by qPCR. Semi-quantitative visual gill health assessments were conducted during the audits, and farms were assigned clinical AGD status based on microscopic visualization of N. perurans together with histopathological lesions. Seawater temperature and salinity data were collected from all active farms in the region during the study period. Trends in gill scores and associations with N. perurans infections were described and tested using an ordinal logistic mixed model. The amoeba was detected in 21% of 345 audited farms and in 12% of 1925 fish samples. Most (56%, n = 1898) samples had no visible gill damage (score = 0), and 23% had scores ≥ 2 (high). Distinct patterns of spatial and temporal variability in the rates of high gill scores and N. perurans infections are demonstrated. The model supported the statistically significant relationship observed between seawater temperature and the proportion of samples with elevated gill scores. The model also revealed a direct relationship between salinity and gill score but only in the presence of N. perurans. While the data suggest that histopathological lesions contributed to the gill scores, temperature and, to a lesser extent, salinity were significant risk factors of increased gill score. The results are discussed in the context of recently frequent thermal anomalies in the northeastern Pacific Ocean.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,533
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,172
Écart entre enseignants0,168 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2022
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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