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Enregistrement W4280574051 · doi:10.1101/2022.04.20.488989

p38 MAPK Signaling Enhances Reovirus Replication by Facilitating Efficient Virus Entry, Virus Capsid Uncoating and Post-Uncoating Steps

2022· preprint· en· W4280574051 sur OpenAlexaff
Adil Mohamed, Maya Shmulevitz

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueVirus-based gene therapy research
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésOncolytic virusVirologyVirusBiologyMAPK/ERK pathwayViral replicationViral entrySignal transductionCell biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Mammalian orthoreovirus serotype 3 Dearing an orphan human virus currently being pursued as an oncolytic virus in multiple phase I/II clinical trials. Previous clinical trials have emphasized the importance of patient pre-screening for prognostic markers to improve therapeutic success. However, currently, only generic cancer markers such as EGFR, Hras, Kras, Nras, Braf and/or p53 are utilized and have exhibited limited benefit in predicting therapeutic efficacy. Utilization of more specific markers that influence specific steps during reovirus replication could prove beneficial as prognostic markers. This study delineated the role of p38 MAPK signaling during reovirus infection and illustrated a connection between specific p38 MAPK isoforms and reovirus infection. Using a panel of specific p38 MAPK inhibitors and an inactive inhibitor analogue, we demonstrated that p38 MAPK signaling is essential for establishment of reovirus infection by enhancing reovirus endocytosis, facilitating efficient reovirus uncoating at the endo-lysosomal stage, and augmenting post uncoating replication steps. Using a broad panel of human breast cancer cell lines, we observed susceptibility of reovirus infection corresponded with virus binding and uncoating efficiency, which was strongly correlated with status of the p38β isoform. Together, our study proposes p38β as a potential prognostic marker for early stages of reovirus infection that are crucial to establishment of successful reovirus infection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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