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Enregistrement W4280574832 · doi:10.1101/2022.05.09.491225

Differentiation of semi-transparent tissue phantom inclusions using optical coherence tomography towards label-free neurography and lymphography

2022· preprint· en· W4280574832 sur OpenAlexaff
Muhammad Mohsin Qureshi, Taylor Peters, Nader Allam, Valentin Demidov, I. Alex Vitkin

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueOptical Coherence Tomography Applications
Établissements canadiensUniversity of TorontoPrincess Margaret Cancer Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésOptical coherence tomographyImaging phantomBiomedical engineeringMagnetic resonance neurographySpeckle patternTexture (cosmology)Lymphatic systemMaterials scienceComputer scienceRadiologyMedicineArtificial intelligencePathologyMagnetic resonance imaging

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Significance Lymphatic and peripheral nervous system imaging is of prime importance for monitoring various important pathologic processes including cancer development, metastasis, and response to therapy. Aim Optical coherence tomography (OCT) is a promising approach for this imaging task but is challenged by the near-transparent nature of these structures. Our aim is to detect and differentiate semi-transparent materials using OCT texture analysis, towards label-free neurography and lymphography. Approach We have recently demonstrated a novel OCT texture analysis-based approach that used speckle statistics to image lymphatics and nerves in-vivo that does not rely on negative contrast. However, these two near-transparent structures could not be differentiated from each other easily in the texture analysis parameter space. Here we perform a rigorous follow-up study to improve upon this differentiation in controlled phantoms mimicking the optical properties of these tissues. Results The results of the three-parameter Rayleigh distribution fit to the OCT images of six types of tissue-mimicking materials varying in transparency and biophysical properties demonstrate clear differences between them, suggesting routes for improved lymphatics-nerves differentiation. Conclusions We demonstrate a novel OCT texture analysis based lymphatics-nerves differentiation methodology in tissue-simulating phantoms. Future work will focus on in-vivo lymphangiography and neurography studies of longitudinal treatment monitoring for therapy feedback and optimization.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,587
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,003
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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