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Enregistrement W4280604344 · doi:10.3390/metabo12050425

Untargeted Metabolomics Identifies a Novel Panel of Markers for Autologous Blood Transfusion

2022· article· en· W4280604344 sur OpenAlexfundno aff
Amna Al-Nesf, Nada Mohamed-Ali, Vanessa Acquaah, Maneera Al-Jaber, Maryam Al‐Nesf, Mohamed A. Yassin, Nelson N. Orie, Sven Christian Voss, Costas Georgakopoulos, Rikesh Bhatt, Alka Beotra, Vidya Mohamed‐Ali, Mohammed Al‐Maadheed

Notice bibliographique

RevueMetabolites · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolomics and Mass Spectrometry Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesWorld Anti-Doping AgencyHamad Medical Corporation
Mots-clésMetabolomicsMedicineBlood transfusionIntensive care medicineComputational biologyBioinformaticsBiologyImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Untargeted metabolomics was used to analyze serum and urine samples for biomarkers of autologous blood transfusion (ABT). Red blood cell concentrates from donated blood were stored for 35−36 days prior to reinfusion into the donors. Participants were sampled at different time points post-donation and up to 7 days post-transfusion. Metabolomic profiling was performed using ACQUITY ultra performance liquid chromatography (UPLC), Q-Exactive high resolution/accurate mass spectrometer interfaced with a heated electrospray ionization (HESI-II) source and Orbitrap mass analyzer operated at 35,000 mass resolution. The markers of ABT were determined by principal component analysis and metabolites that had p < 0.05 and met ≥ 2-fold change from baseline were selected. A total of 11 serum and eight urinary metabolites, including two urinary plasticizer metabolites, were altered during the study. By the seventh day post-transfusion, the plasticizers had returned to baseline, while changes in nine other metabolites (seven serum and two urinary) remained. Five of these metabolites (serum inosine, guanosine and sphinganine and urinary isocitrate and erythronate) were upregulated, while serum glycourdeoxycholate, S-allylcysteine, 17-alphahydroxypregnenalone 3 and Glutamine conjugate of C6H10O2 (2)* were downregulated. This is the first study to identify a panel of metabolites, from serum and urine, as markers of ABT. Once independently validated, it could be universally adopted to detect ABT.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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