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Enregistrement W4280615170 · doi:10.1038/s41598-022-12546-1

Corticotropin releasing hormone as an identifier of bronchiolitis obliterans syndrome

2022· article· en· W4280615170 sur OpenAlexaff
Anna Niroomand, Haider Ghaidan, Oskar Hällgren, Lennart Hansson, Hillevi Larsson, Darcy E. Wagner, Martina Macková, K. Halloran, Snejana Hyllén, Sandra Lindstedt

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTransplantation: Methods and Outcomes
Établissements canadiensThe Metabolomics Innovation CentreUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesMarcus och Amalia Wallenbergs minnesfondKnut och Alice Wallenbergs StiftelseLunds Universitet
Mots-clésBronchiolitis obliteransBiomarkerLung transplantationBronchiolitisTransplantationMedicineMultiplexLungImmunoassayImmunologyAntibodyBiologyInternal medicineBioinformaticsRespiratory system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Lung transplantion (LTx) recipients have low long-term survival and a high incidence of bronchiolitis obliterans syndrome (BOS), an inflammation of the small airways in chronic rejection of a lung allograft. There is great clinical need for a minimally invasive biomarker of BOS. Here, 644 different proteins were analyzed to detect biomarkers that distinguish BOS grade 0 from grades 1-3. The plasma of 46 double lung transplant patients was analyzed for proteins using a high-component, multiplex immunoassay that enables analysis of protein biomarkers. Proximity Extension Assay (PEA) consists of antibody probe pairs which bind to targets. The resulting polymerase chain reaction (PCR) reporter sequence can be quantified by real-time PCR. Samples were collected at baseline and 1-year post transplantation. Enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) was used to validate the findings of the PEA analysis across both time points and microarray datasets from other lung transplantation centers demonstrated the same findings. Significant decreases in the plasma protein levels of CRH, FERC2, IL-20RA, TNFB, and IGSF3 and an increase in MMP-9 and CTSL1 were seen in patients who developed BOS compared to those who did not. In this study, CRH is presented as a novel potential biomarker in the progression of disease because of its decreased levels in patients across all BOS grades. Additionally, biomarkers involving the remodeling of the extracellular matrix (ECM), such as MMP-9 and CTSL1, were increased in BOS patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,311
Écart entre enseignants0,290 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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