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Enregistrement W4280619198 · doi:10.1101/2022.05.16.491899

Sexual selection and pseudogenization in primate fertilization

2022· preprint· en· W4280619198 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSperm and Testicular Function
Établissements canadiensSimon Fraser University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyPseudogeneSexual selectionEvolutionary biologyPrimateSexual dimorphismSperm competitionGeneSelection (genetic algorithm)Sexual conflictGeneticsZoologyGenomeEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The mouse sperm protein ZP3R interacts with proteins in the egg coat and mediates sperm–egg adhesion in a species-specific manner. Understanding the function and evolution of such genes has important implications for studies of speciation, reproductive success, and infertility. A recent analysis showed that (1) the human pseudogene C4BPAP1 is the ortholog of Zp3r , (2) ZP3R pseudogenization evolved independently in parallel among several primate lineages, and (3) functional ZP3R genes evolve under positive selection among other primate species. The causes of this pseudogenization of ZP3R are unknown. To explore one plausible cause (changes in sexual selection on males), we searched for ZP3R pseudogenes in recently published genomes, then compared sexually selected male traits among lineages with and without a functional ZP3R . We found that traits associated with more intense sexual selection on males (large male body size, larger male canines, larger testes) were associated with functional ZP3R expression, and suggest that a relaxation of sexual selection may be associated with selection for ZP3R pseudogenization. This proposed causal relationship implies an evolutionary cost to maintaining redundancy in the suite of primate fertilization genes. Lay summary In sexual interactions more is often assumed to be better. But the evolution of animal genomes suggests that sometimes less is more: the adaptive loss of genes that function in sex may be favored by selection. How could this happen? One surprising answer comes from analyzing humans and some other primate species that have turned off a key gene called ZP3R that helps sperm bind to eggs. The loss of that gene function in some primates is associated with male traits (smaller bodies, smaller canines, smaller testes) that often indicate less vigorous selection on males to compete for matings with females. That correlation implies that the same selection acting on male morphological traits may also act on sperm molecular traits. The correlation also implies that it’s expensive to keep some genes turned on, and that when they’re no longer helpful it’s adaptive to turn them off or allow them to become fallow. This economy of gene expression in sex is an under-explored area of research.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,238
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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