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Enregistrement W4280644896 · doi:10.1101/2022.05.18.492546

mRNA-based vaccines against SARS-CoV-2 do not stimulate interferon stimulatory gene expression in individuals affected by Aicardi Goutières Syndrome

2022· preprint· en· W4280644896 sur OpenAlexaff
Asako Takanohashi, Mohamad‐Gabriel Alameh, Sarah Woidill, Julia Hacker, Benjamin Davis, Guy Helman, Francesco Gavazzi, Laura Adang, Russell D’Aiello, Patrick Winters, Devon Cordova, Taibeen Khandaker, Houping Ni, Ying K. Tam, Paulo J.C. Lin, Drew Weissman, Justine Shults, Adeline Vanderver

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
Thématiqueinterferon and immune responses
Établissements canadiensAcuitas Therapeutics (Canada)
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeChildren's Hospital of Philadelphia
Mots-clésInterferonVaccinationImmunologyBiologyMessenger RNAInternalizationVirologyGeneDiseaseGene expressionInterferon gammaMedicineImmune systemCellGeneticsInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) poses threats to individuals with rare disease, in part because so little is known about the impact of COVID-19 infection and vaccination safety in rare disease populations. Of particular concern, given the overlap in disease manifestations and interferon dysregulation, are a group of heritable autoinflammatory conditions called type I interferonopathies. The most common of these, Aicardi Goutières Syndrome (AGS), is caused by altered nucleic acid metabolism and sensing, resulting in additional concerns surrounding the use of mRNA vaccination approaches. To determine whether mRNA vaccines induce an interferon response in AGS, we applied mRNA SARS-CoV-2 vaccines to whole blood samples and assessed internalization and interferon signaling gene expression responses to the mRNA. In all cases (11 AGS and 11 control samples), interferon signatures did not significantly increase from baseline, regardless of baricitinib treatment status in the AGS subjects, and were even decreased, when using codon optimized SARS-CoV-2 di-proline modified spike sequence (S2P). Internalization of S2P in human dendritic cells was verified by Western Blot, and in control and AGS blood cells was verified by Luciferase activity. Although numbers of tested samples in this rare disease are small, based on these findings, we suggest that COVID vaccination is unlikely to directly stimulate the interferon signaling gene expression in AGS patients via response to mRNA internalization. The in vitro nature of this study cannot exclude an exaggerated interferon response to spike protein production at a systemic level in individuals with a primary heritable interferonopathy. In the context of continued SARS-CoV-2 spread in the community, we do not recommend withholding vaccination in this rare disease group. However, we recommend that vaccinations for AGS patients are provided in a controlled setting with appropriate observation and used with caution in individuals with prior vaccine associated adverse events.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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