CTLA4 haploinsufficiency caused by a novel heterozygous splice site mutation
Notice bibliographique
Résumé
Background: Cytotoxic T lymphocyte-associated antigen-4 (CTLA4) haploinsufficiency is characterized by a variety of phenotypes, ranging from autoimmune disorders, enteropathy, fatal combined immunodeficiency, as well as lymphoproliferation and malignancy. Aim: To broaden the genotypic spectrum and clinical presentations of patients with CTLA4 variants. Methods: We evaluated a female patient with autoimmunity and lymphopenia. Immune workup and whole exome sequencing (WES) were performed. Results: The proband presented at 11 years of age with hypothyroidism and later developed Evans syndrome, alopecia, eczema, and lymphocytic interstitial pneumonia. Immune evaluation revealed T, B, and NK lymphopenia with normal humoral immunity. Following a negative genetic panel for autoimmune lymphoproliferative syndrome (ALPS), WES analysis identified a novel heterozygous intronic variant predicted in-silico to cause skipping of exon 2 of the CTLA4 gene. Conclusion: A novel heterozygous mutation in CTLA4 caused variable presentations of immune dysregulation, one of the hallmarks of CTLA4 haploinsufficiency. Statement of Novelty: We herein report a novel mutation in CTLA4 resulting in various features of autoimmunity.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».