Circumscription and typification of sphagnicolous omphalinoid species of Arrhenia (Hygrophoraceae) in Newfoundland and Labrador: three obligate and one facultative species
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Molecular studies of sphagnicolous arrhenias in Newfoundland and Labrador (NL) revealed four clades in Arrhenia, three obligate (two scaly capped and one smooth-capped) and one facultative (smooth-capped) sphagnophiles. Critical nomenclatural review of 16 names used for omphalinoid sphagnicolous taxa in the past left five suitable to apply to this group. One scaly capped obligate sphagnophilic clade contained the type for Arr. gerardiana and the other, the type for Clitocybe gerardiana var. fusca; the latter we introduce as the novel species Arr. bigelowii. It differed from the first by longer spores and a darkening reaction in 10% of collections. The smooth-capped third obligate sphagnophilic clade contained the types of Agaricus telmatiaeus and Omphalina fusconigra; we recombined it as Arr. telmatiaea. This is the darkest species of the group, with a more northern distribution in NL. The facultative sphagnophile was identified as Arr. philonotis, a lighter smooth-capped species also with a more northern distribution in NL. Unexpectedly, we also collected an unidentified smooth-capped facultatively sphagnophilic species of Omphalina of the O. pyxidata complex. All five species are distributed in both Europe and North America. We describe each species of Arrhenia with a sequenced type, providing new type material where needed. Overall, this study adds new sequences from over 80 specimens of sphagnicolous arrhenias to the two existing in GenBank when we began in 2006, 11 new sequences of the unidentified species of Omphalina, and several other arrhenias.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».