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Enregistrement W4281262685 · doi:10.1186/s13104-022-06075-3

Examining the role of person-to-person transmission during a verocytotoxigenic Escherichia coli outbreak in Ontario, Canada

2022· article· en· W4281262685 sur OpenAlexafffundabout
Roksolana Hovdey, Jan M. Sargeant, David N. Fisman, Amy L. Greer

Notice bibliographique

RevueBMC Research Notes · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEscherichia coli research studies
Établissements canadiensPublic Health OntarioUniversity of TorontoUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchCanada Research Chairs
Mots-clésOutbreakTransmission (telecommunications)Escherichia coliMedicineEnvironmental healthGeographyVirologyBiologyComputer scienceTelecommunicationsGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: Person-to-person transmission can occur during outbreaks of verotoxigenic Escherichia coli (VTEC), however the impact of this transmission route is not well understood. This study aimed to examine the role of person-to-person transmission during a VTEC outbreak, and how targeting this route may reduce outbreak size. A deterministic compartmental model describing a VTEC outbreak was constructed and fit to data from a 2008 outbreak in Ontario, Canada. Using the best-fit model, simulations were run to calculate the: reduction in transmission rate after implementing interventions, proportion of cases infected through both transmission routes, and number of cases prevented by interventions. Latin hypercube sensitivity analysis was conducted to examine the sensitivity of the outbreak size to the model parameters. RESULTS: Based on the best-fit model, ~ 14.25% of the cases likely arose due to person-to-person transmission. Interventions reduced this transmission rate by ~ 73%, causing a reduction in outbreak size of ~ 17% (47 cases). Sensitivity analysis showed that the model was highly sensitive to changes in all parameters of the model. The model demonstrates that person-to-person could be an important transmission route during VTEC outbreaks. Targeting this route of transmission through hand hygiene and work exclusions could reduce the final outbreak size.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,522
Score d'incertitude au seuil0,547

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,073
Tête enseignante GPT0,304
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2022
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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