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Enregistrement W4281390206 · doi:10.1371/journal.pbio.3001637

Early rhythmicity in the fetal suprachiasmatic nuclei in response to maternal signals detected by omics approach

2022· article· en· W4281390206 sur OpenAlexfundno aff
Philipp Greiner, Pavel Houdek, Martin Sládek, Alena Sumová

Notice bibliographique

RevuePLoS Biology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueCircadian rhythm and melatonin
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversity of TorontoGrantová Agentura České Republiky
Mots-clésBiologySuprachiasmatic nucleusCircadian rhythmPeriod (music)TranscriptomeCLOCKRhythmHypothalamusFetusCircadian clockNeuroscienceEndocrinologyInternal medicineGeneGene expressionGeneticsPregnancy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The suprachiasmatic nuclei (SCN) of the hypothalamus harbor the central clock of the circadian system, which gradually matures during the perinatal period. In this study, time-resolved transcriptomic and proteomic approaches were used to describe fetal SCN tissue-level rhythms before rhythms in clock gene expression develop. Pregnant rats were maintained in constant darkness and had intact SCN, or their SCN were lesioned and behavioral rhythm was imposed by temporal restriction of food availability. Model-selecting tools dryR and CompareRhythms identified sets of genes in the fetal SCN that were rhythmic in the absence of the fetal canonical clock. Subsets of rhythmically expressed genes were assigned to groups of fetuses from mothers with either intact or lesioned SCN, or both groups. Enrichment analysis for GO terms and signaling pathways revealed that neurodevelopment and cell-to-cell signaling were significantly enriched within the subsets of genes that were rhythmic in response to distinct maternal signals. The findings discovered a previously unexpected breadth of rhythmicity in the fetal SCN at a developmental stage when the canonical clock has not yet developed at the tissue level and thus likely represents responses to rhythmic maternal signals.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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