Generation of a mouse model of the neurodevelopmental disorder with dysmorphic facies and distal limb anomalies syndrome
Notice bibliographique
Résumé
Heterozygous variants in bromodomain and plant homeodomain containing transcription factor (BPTF) cause the neurodevelopmental disorder with dysmorphic facies and distal limb anomalies (NEDDFL) syndrome (MIM#617755) characterized by intellectual disability, speech delay and postnatal microcephaly. BPTF functions within nucleosome and remodeling factor (NURF), a complex comprising sucrose non-fermenting like (SNF2L), an Imitation SWItching (ISWI) chromatin remodeling protein encoded by the SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 1 (SMARCA1) gene. Surprisingly, ablation of Smarca1 resulted in mice with enlarged brains, a direct contrast to the phenotype of NEDDFL patients. To model the NEDDFL syndrome, we generated forebrain-specific Bptf knockout (Bptf conditional Knockout (cKO)) mice. The Bptf cKO mice were born in normal Mendelian ratios, survived to adulthood but were smaller in size with severe cortical hypoplasia. Prolonged progenitor cell cycle length and a high incidence of cell death reduced the neuronal output. Cortical lamination was also disrupted with reduced proportions of deep layer neurons, and neuronal maturation defects that impaired the acquisition of distinct cell fates (e.g. COUP-TF-interacting protein 2 (Ctip2)+ neurons). RNAseq and pathway analysis identified altered expression of fate-determining transcription factors and the biological pathways involved in neural development, apoptotic signaling and amino acid biosynthesis. Dysregulated genes were enriched for MYC Proto-Oncogene, BHLH Transcription Factor (Myc)-binding sites, a known BPTF transcriptional cofactor. We propose the Bptf cKO mouse as a valuable model for further study of the NEDDFL syndrome.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,003 | 0,003 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,006 | 0,003 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».