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Enregistrement W4281398472 · doi:10.1016/j.celrep.2022.110856

DDX41 is required for cGAS-STING activation against DNA virus infection

2022· article· en· W4281398472 sur OpenAlexafffund
Ravi Shankar Singh, Venkatasubramanian Vidhyasagar, Shizhuo Yang, Ananna Bhadra Arna, Manisha Yadav, Aanchal Aggarwal, Alexya N. Aguilera, Kalpana K. Bhanumathy, Kannupriya Pandey, Aizhang Xu, Noreen Rapin, Mark Bosch, John F. DeCoteau, Jim Xiang, Franco J. Vizeacoumar, Yan Zhou, Vikram Misra, Hirotaka Matsui, Susan R. Ross, Yuliang Wu

Notice bibliographique

RevueCell Reports · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
Thématiqueinterferon and immune responses
Établissements canadiensSaskatchewan Cancer AgencyUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNational Institutes of HealthCanada Foundation for InnovationCanadian Cancer SocietySaskatchewan Health Research FoundationCancer Research Society
Mots-clésRNA Helicase AInterferonDNAWild typeRecombinant DNAMutantBiologyInterferon type IMolecular biologyHelicaseCell biologyChemistryGeneVirologyRNABiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Upon binding double-stranded DNA (dsDNA), cyclic GMP-AMP synthase (cGAS) is activated and initiates the cGAS-stimulator of IFN genes (STING)-type I interferon pathway. DEAD-box helicase 41 (DDX41) is a DEAD-box helicase, and mutations in DDX41 cause myelodysplastic syndromes (MDSs) and acute myeloid leukemia (AML). Here, we show that DDX41-knockout (KO) cells have reduced type I interferon production after DNA virus infection. Unexpectedly, activations of cGAS and STING are affected in DDX41 KO cells, suggesting that DDX41 functions upstream of cGAS. The recombinant DDX41 protein exhibits ATP-dependent DNA-unwinding activity and ATP-independent strand-annealing activity. The MDS/AML-derived mutant R525H has reduced unwinding activity but retains normal strand-annealing activity and stimulates greater cGAS dinucleotide-synthesis activity than wild-type DDX41. Overexpression of R525H in either DDX41-deficient or -proficient cells results in higher type I interferon production. Our results have led to the hypothesis that DDX41 utilizes its unwinding and annealing activities to regulate the homeostasis of dsDNA and single-stranded DNA (ssDNA), which, in turn, regulates cGAS-STING activation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,343
Score d'incertitude au seuil0,855

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations83
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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