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Enregistrement W4281554647 · doi:10.1002/ana.26423

Integrative Approach to Predict Severity in Nonketotic Hyperglycinemia

2022· article· en· W4281554647 sur OpenAlexaff
Oya Kuseyri Hübschmann, Natalia Juliá‐Palacios, Mireia Olivella, Philipp Guder, Dimitrios Zafeiriou, Gabriella Horváth, Jan Kulhánek, Toni S. Pearson, Alice Kuster, Elisenda Cortès‐Saladelafont, Salvador Ibáñez, Maria Concepción García‐Jiménez, Tomáš Honzík, René Santer, Kathrin Jeltsch, Sven F. Garbade, Georg F. Hoffmann, Thomas Opladen, Ángeles García‐Cazorla

Notice bibliographique

RevueAnnals of Neurology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolism and Genetic Disorders
Établissements canadiensBC Children's HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesEuropean Regional Development FundInstituto de Salud Carlos IIIMinisterstvo Zdravotnictví Ceské Republiky
Mots-clésHyperglycinemiaArea under the curveInternal medicineCerebrospinal fluidGastroenterologyEncephalopathyMedicineGlycinePediatricsBiologyAmino acidGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: Glycine encephalopathy, also known as nonketotic hyperglycinemia (NKH), is an inherited neurometabolic disorder with variable clinical course and severity, ranging from infantile epileptic encephalopathy to psychiatric disorders. A precise phenotypic characterization and an evaluation of predictive approaches are needed. METHODS: Longitudinal clinical and biochemical data of 25 individuals with NKH from the patient registry of the International Working Group on Neurotransmitter Related Disorders were studied with in silico analyses, pathogenicity scores, and molecular modeling of GLDC and AMT variants. RESULTS: Symptom onset (p < 0.01) and diagnosis occur earlier in life in severe NKH (p < 0.01). Presenting symptoms affect the age at diagnosis. Psychiatric problems occur predominantly in attenuated NKH. Onset age ≥ 3 months (66% specificity, 100% sensitivity, area under the curve [AUC] = 0.87) and cerebrospinal fluid (CSF)/plasma glycine ratio ≤ 0.09 (57% specificity, 100% sensitivity, AUC = 0.88) are sensitive indicators for attenuated NKH, whereas CSF glycine concentration ≥ 116.5μmol/l (100% specificity, 93% sensitivity, AUC = 0.97) and CSF/plasma glycine ratio ≥ 0.15 (100% specificity, 64% sensitivity, AUC = 0.88) are specific for severe forms. A ratio threshold of 0.128 discriminates the overlapping range. We present 10 new GLDC variants. Two mild variants resulted in attenuated, whereas 2 severe variants or 1 mild and 1 severe variant led to severe phenotype. Based on clinical, biochemical, and genetic parameters, we propose a severity prediction model. INTERPRETATION: This study widens the phenotypic spectrum of attenuated NKH and expands the number of pathogenic variants. The multiparametric approach provides a promising tool to predict disease severity, helping to improve clinical management strategies. ANN NEUROL 2022;92:292-303.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,273
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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