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Enregistrement W4281569527 · doi:10.1111/cge.14165

Biallelic variants in <scp><i>ZNF142</i></scp> lead to a syndromic neurodevelopmental disorder

2022· article· en· W4281569527 sur OpenAlexfundno aff
Maria Bejerholm Christensen, Amanda M. Levy, Nazanin A. Mohammadi, Marcello Niceta, Rauan Kaiyrzhanov, Maria Lisa Dentici, Chadi Al Alam, Viola Alesi, Valérie Benoît, Kailash P. Bhatia, Tatjana Bierhals, Christian M. Boßelmann, Julien Buratti, Bert Callewaert, Berten Ceulemans, Perrine Charles, Matthias De Wachter, Mohammadreza Dehghani, Erika D’haenens, Martine Doco‐Fenzy, Michaela Geßner, Cyrielle Gobert, Ulviyya Guliyeva, Tobias B. Haack, Trine Bjørg Hammer, T. Heinrich, Maja Hempel, Theresia Herget, Ute A. Hoffmann, Judit Horváth, Henry Houlden, Boris Keren, Christina Kresge, Candy Kumps, Damien Lederer, Alban Lermine, Francesca Magrinelli, Reza Maroofian, Mohammad Yahya Vahidi Mehrjardi, Mahdiyeh Moudi, Amelie J. Müller, Anna Oostra, Beth A. Pletcher, David Ros‐Pardo, Shanika Samarasekera, Marco Tartaglia, Kristof Van Schil, Julie Vogt, Evangeline Wassmer, Juliane Winkelmann, Maha S. Zaki, Michael Zech, Holger Lerche, Francesca Clementina Radio, Paulino Gómez‐Puertas, Rikke S. Møller, Zeynep Tümer

Notice bibliographique

RevueClinical Genetics · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics and Neurodevelopmental Disorders
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUCLH Biomedical Research CentreMedical Research CouncilMedical Research Council CanadaDeutsche ForschungsgemeinschaftMinistero della SaluteMichael J. Fox Foundation for Parkinson's ResearchRosetrees TrustWellcome TrustBundesministerium für Bildung und Forschung
Mots-clésMissense mutationPhenotypeHypotoniaIntellectual disabilityGeneticsNeurodevelopmental disorderBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Biallelic variants of the gene encoding for the zinc-finger protein 142 (ZNF142) have recently been associated with intellectual disability (ID), speech impairment, seizures, and movement disorders in nine individuals from five families. In this study, we obtained phenotype and genotype information of 26 further individuals from 16 families. Among the 27 different ZNF142 variants identified in the total of 35 individuals only four were missense. Missense variants may give a milder phenotype by changing the local structure of ZF motifs as suggested by protein modeling; but this correlation should be validated in larger cohorts and pathogenicity of the missense variants should be investigated with functional studies. Clinical features of the 35 individuals suggest that biallelic ZNF142 variants lead to a syndromic neurodevelopmental disorder with mild to moderate ID, varying degrees of delay in language and gross motor development, early onset seizures, hypotonia, behavioral features, movement disorders, and facial dysmorphism. The differences in symptom frequencies observed in the unpublished individuals compared to those of published, and recognition of previously underemphasized facial features are likely to be due to the small sizes of the previous cohorts, which underlines the importance of larger cohorts for the phenotype descriptions of rare genetic disorders.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,366
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,297
Écart entre enseignants0,270 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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