The 43rd Annual Meeting of the Canadian College of Neuropsychopharmacology, November 4, 2021
Notice bibliographique
Résumé
Background: Depression is a prevalent psychiatric disorder characterized by heterogeneous symptoms that can last a lifetime and remain even after several courses of antidepressant treatments.Vulnerability to depression is associated with long-lasting changes in the transcriptional profile of the nucleus accumbens (NAcc), a brain region involved in reward and mood regulation.Methods: Here, we characterized the enduring changes in histone modifications in the NAcc of mice exposed to chronic social defeat stress (CSDS), a validated model for the study of depression-like behaviours that separates mouse populations into susceptible (SUS) and resilient (RES) based on a social interaction test (SIT).Tissue from the NAcc of control, SUS, and RES mice was collected either 24 hours or 4 weeks after the SIT and processed for histone profiling via mass spectrometry.In parallel, we mapped the genome-wide enrichment of the most changed histone modifications using CUT&RUN and assessed for chromatin accessibility in a cell-specific manner using ATAC-Seq.Results: CSDS alters the methylation (me) dynamics of lysine (K) 27 of the histone variant H3.3 -the predominant form of H3 present in adult brain neurons.Specifically, we observed an increase in the abundance of H3.3K27me1 and a decrease in the abundance of H3.3K27me2 in the NAcc of SUS mice.Gen omic distribution shows that H3.3K27me1 is primarily enriched in gene bodies and proximal promoters, suggesting its crucial role in determining stress-induced transcriptional profiles.In contrast, H3.3K27me2 is weakly deposited across intergenic regions.Using bioinformatics, we are currently identifying changes of chromatin accessibility and functional regulatory elements that coincide with H3.3K27me1 enrichment.Conclusion: Our results suggest that H3.3K27me1 and H3.3K27me2 are important chromatin "scars" that mediate enduring susceptibility to stress in the NAcc.Understanding the molecular basis of these adaptations and identifying the genomic regions affected will shed new light on persisting forms of stress-induced pathology.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,003 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,003 | 0,003 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,334 | 0,145 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».